22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2989 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2656  hypothetical protein  62.46 
 
 
940 aa  997    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.984496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2871  hypothetical protein  57.24 
 
 
963 aa  948    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.893602  normal  0.450049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2989  hypothetical protein  100 
 
 
898 aa  1721    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.247413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2903  hypothetical protein  58.51 
 
 
948 aa  924    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00602685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1663  hypothetical protein  70.7 
 
 
895 aa  1101    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3631  hypothetical protein  67.96 
 
 
951 aa  968    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4952  hypothetical protein  64.12 
 
 
884 aa  996    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2041  hypothetical protein  70.7 
 
 
889 aa  1098    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3096  hypothetical protein  62.38 
 
 
974 aa  964    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2487  hypothetical protein  27.35 
 
 
815 aa  67.8  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  27.5 
 
 
932 aa  66.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
944 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  24.46 
 
 
905 aa  55.8  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  23.35 
 
 
968 aa  52  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  25.57 
 
 
597 aa  51.6  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  25 
 
 
569 aa  51.6  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0556  protein of unknown function DUF349  22.73 
 
 
634 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2892  protein of unknown function DUF349  22.81 
 
 
757 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.600773  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  25.2 
 
 
589 aa  47.8  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  25.95 
 
 
599 aa  47.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1361  protein of unknown function DUF349  26.18 
 
 
483 aa  45.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17600  protein of unknown function (DUF349)  24.9 
 
 
559 aa  45.8  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0425938 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>