16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3096 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2656  hypothetical protein  61.86 
 
 		 940 aa  941    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.984496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2871  hypothetical protein  64.57 
 
 		 963 aa  731    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.893602  normal  0.450049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2989  hypothetical protein  68.97 
 
 		 898 aa  795    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2903  hypothetical protein  58.89 
 
 		 948 aa  933    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00602685 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1663  hypothetical protein  67.58 
 
 		 895 aa  760    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3631  hypothetical protein  62.03 
 
 		 951 aa  890    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4952  hypothetical protein  63.64 
 
 		 884 aa  748    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2041  hypothetical protein  60.74 
 
 		 889 aa  934    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3096  hypothetical protein  100 
 
 		 974 aa  1878    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2487  hypothetical protein  27.59 
 
 		 815 aa  70.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  24.82 
 
 		 968 aa  63.9  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  27.27 
 
 		 932 aa  59.7  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  23.62 
 
 		 905 aa  54.7  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  28.52 
 
 		 599 aa  53.5  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3046  protein of unknown function DUF349  27.27 
 
 		 417 aa  45.8  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0729662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  27.87 
 
 		 597 aa  44.7  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>