40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3028 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3028  hypothetical protein  100 
 
 		 920 aa  1782    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2487  hypothetical protein  27.05 
 
 		 815 aa  167  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  22.37 
 
 		 932 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01264  hypothetical protein  25.14 
 
 		 968 aa  108  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.744228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  25.36 
 
 		 905 aa  87.8  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 944 aa  67.8  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1274  hypothetical protein  30.53 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.373171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  23.56 
 
 		 589 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0556  protein of unknown function DUF349  24.19 
 
 		 634 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3985  protein of unknown function DUF349  27.31 
 
 		 673 aa  55.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0275004  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2871  hypothetical protein  26.43 
 
 		 963 aa  54.7  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.893602  normal  0.450049 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1796  protein of unknown function DUF349  28.89 
 
 		 448 aa  54.3  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2892  protein of unknown function DUF349  23.78 
 
 		 757 aa  53.9  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.600773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27670  protein of unknown function (DUF349)  31.02 
 
 		 445 aa  52.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.996062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12744  hypothetical protein  30.08 
 
 		 450 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.64322  normal  0.329555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2587  hypothetical protein  26.13 
 
 		 659 aa  52.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.864183  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06725  hypothetical protein  21.72 
 
 		 733 aa  50.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4162  hypothetical protein  30.77 
 
 		 425 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177511  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0016  hypothetical protein  25.88 
 
 		 486 aa  50.4  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0238  hypothetical protein  26.64 
 
 		 429 aa  49.7  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00701852  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3910  protein of unknown function DUF349  32.28 
 
 		 522 aa  49.7  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1486  hypothetical protein  30.07 
 
 		 407 aa  49.7  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.904354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2001  protein of unknown function DUF349  30.92 
 
 		 610 aa  49.7  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381197  normal  0.0850448 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0173  protein of unknown function DUF349  22.11 
 
 		 610 aa  48.9  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.831825  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2431  hypothetical protein  27.03 
 
 		 465 aa  48.5  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436145 
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  22.48 
 
 		 626 aa  48.1  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  34.19 
 
 		 569 aa  47.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2211  protein of unknown function DUF349  28.5 
 
 		 469 aa  47.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.526181  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1401  hypothetical protein  29.63 
 
 		 402 aa  47  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317251 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1663  hypothetical protein  26.34 
 
 		 895 aa  46.2  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2362  protein of unknown function DUF349  31.68 
 
 		 414 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2205  hypothetical protein  27.12 
 
 		 459 aa  46.2  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0783  hypothetical protein  26.43 
 
 		 456 aa  45.8  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2146  hypothetical protein  27.12 
 
 		 459 aa  46.2  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2159  hypothetical protein  27.12 
 
 		 459 aa  46.2  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2088  hypothetical protein  30.53 
 
 		 433 aa  45.8  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1442  protein of unknown function DUF349  27.84 
 
 		 448 aa  45.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1443  hypothetical protein  28.48 
 
 		 402 aa  44.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2041  hypothetical protein  26.81 
 
 		 889 aa  44.7  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  28.1 
 
 		 599 aa  44.3  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>