30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4120 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4120  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  850    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5235  protein of unknown function DUF349  59.14 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 944 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  22.28 
 
 		 905 aa  64.3  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2362  protein of unknown function DUF349  23.22 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  24.28 
 
 		 932 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1443  hypothetical protein  24.68 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  31.08 
 
 		 626 aa  61.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1401  hypothetical protein  25.32 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6105  hypothetical protein  21.05 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2211  protein of unknown function DUF349  24.62 
 
 		 469 aa  57  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.526181  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3092  protein of unknown function DUF349  21.6 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2057  hypothetical protein  22.75 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1486  hypothetical protein  24.68 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.904354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2394  hypothetical protein  22.26 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4162  hypothetical protein  23.17 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177511  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2118  protein of unknown function DUF349  22.09 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0210704  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  25.4 
 
 		 589 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2892  protein of unknown function DUF349  26.75 
 
 		 757 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.600773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0173  protein of unknown function DUF349  23.59 
 
 		 610 aa  50.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.831825  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27670  protein of unknown function (DUF349)  23.32 
 
 		 445 aa  50.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.996062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3985  protein of unknown function DUF349  21.18 
 
 		 673 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0275004  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2088  hypothetical protein  20.74 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425987  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0556  protein of unknown function DUF349  26.67 
 
 		 634 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2587  hypothetical protein  24.67 
 
 		 659 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.864183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1442  protein of unknown function DUF349  25.21 
 
 		 448 aa  46.6  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2487  hypothetical protein  40.35 
 
 		 815 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2639  hypothetical protein  29.89 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0461  hypothetical protein  23.62 
 
 		 479 aa  43.5  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3028  hypothetical protein  26.09 
 
 		 920 aa  43.5  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>