46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5235 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5235  protein of unknown function DUF349  100 
 
 		 425 aa  850    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.809819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4120  hypothetical protein  59.14 
 
 		 426 aa  485  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0120  putative CheA signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 		 944 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6105  hypothetical protein  25.94 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.525497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2362  protein of unknown function DUF349  28.09 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1486  hypothetical protein  27.07 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.904354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1443  hypothetical protein  25.83 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4162  hypothetical protein  25.59 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177511  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1772  hypothetical protein  24.17 
 
 		 589 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.200656  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2211  protein of unknown function DUF349  27.78 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.526181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27670  protein of unknown function (DUF349)  35.71 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.996062 
 
 
-
 
NC_002950  PG1189  hypothetical protein  28.32 
 
 		 626 aa  71.6  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3985  protein of unknown function DUF349  26.54 
 
 		 673 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0275004  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2394  hypothetical protein  25.37 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0461  hypothetical protein  32.85 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.592182  normal  0.120209 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1401  hypothetical protein  24.74 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2057  hypothetical protein  24.04 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3092  protein of unknown function DUF349  23.8 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6156  hypothetical protein  30.66 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2118  protein of unknown function DUF349  25.36 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0210704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1442  protein of unknown function DUF349  28.28 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2892  protein of unknown function DUF349  25 
 
 		 757 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.600773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3965  hypothetical protein  26.53 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2587  hypothetical protein  26.79 
 
 		 659 aa  60.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.864183  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2088  hypothetical protein  25.18 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425987  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0173  protein of unknown function DUF349  27.2 
 
 		 610 aa  60.1  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.831825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1645  hypothetical protein  29.55 
 
 		 932 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06725  hypothetical protein  25.33 
 
 		 733 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3046  protein of unknown function DUF349  29.01 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0729662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1361  protein of unknown function DUF349  24.24 
 
 		 483 aa  54.3  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1796  protein of unknown function DUF349  25.47 
 
 		 448 aa  53.9  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1677  protein of unknown function DUF349  30.37 
 
 		 597 aa  53.9  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.21168  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1803  protein of unknown function DUF349  29.01 
 
 		 569 aa  51.2  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0809623  normal  0.0235589 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12820  protein of unknown function (DUF349)  24.15 
 
 		 512 aa  50.4  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.721918  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0016  hypothetical protein  32.52 
 
 		 486 aa  50.4  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2566  hypothetical protein  24.3 
 
 		 905 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3910  protein of unknown function DUF349  28.31 
 
 		 522 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2001  protein of unknown function DUF349  32.5 
 
 		 610 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381197  normal  0.0850448 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2295  hypothetical protein  28.12 
 
 		 557 aa  47.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00478543  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0783  hypothetical protein  32.14 
 
 		 456 aa  46.6  0.0009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2639  hypothetical protein  25.78 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2146  hypothetical protein  22.68 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2205  hypothetical protein  22.68 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2025  protein of unknown function DUF349  25.78 
 
 		 521 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000837835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2159  hypothetical protein  22.68 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14030  protein of unknown function (DUF349)  25.28 
 
 		 599 aa  43.5  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>