More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0782 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0782  GTP-binding proten HflX  100 
 
 
357 aa  707    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000937101  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  42.9 
 
 
417 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  40.35 
 
 
509 aa  246  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  42.49 
 
 
435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  46.86 
 
 
503 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  40.52 
 
 
441 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  43.58 
 
 
582 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.25 
 
 
486 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  42.9 
 
 
441 aa  236  6e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  43.86 
 
 
414 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  42.03 
 
 
432 aa  229  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  42.35 
 
 
421 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  40.29 
 
 
493 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  38.73 
 
 
502 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  44.67 
 
 
421 aa  226  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  39.16 
 
 
517 aa  226  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0122  GTP-binding protein HSR1-related  40.74 
 
 
421 aa  226  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000776229  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  38.5 
 
 
433 aa  225  8e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  41.21 
 
 
429 aa  225  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  41.6 
 
 
487 aa  225  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  42.72 
 
 
439 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  39.89 
 
 
515 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  42.95 
 
 
431 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  40.92 
 
 
429 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  41.39 
 
 
479 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  42.48 
 
 
395 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.4 
 
 
493 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  40.06 
 
 
484 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1744  small GTP-binding protein  42.48 
 
 
396 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  42.48 
 
 
395 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  40.69 
 
 
493 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  42.48 
 
 
396 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  41.67 
 
 
435 aa  223  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  41.91 
 
 
435 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  42.77 
 
 
404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1717  GTP-binding proten HflX  42.18 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658318  normal  0.277641 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  42.77 
 
 
404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  41.59 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  43.19 
 
 
426 aa  222  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  43.19 
 
 
426 aa  222  7e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  43.19 
 
 
426 aa  222  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  43.19 
 
 
426 aa  222  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  43.19 
 
 
426 aa  222  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  43.19 
 
 
426 aa  222  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  43.19 
 
 
426 aa  222  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  43.19 
 
 
426 aa  222  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  43.19 
 
 
426 aa  222  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  42.36 
 
 
432 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  42.43 
 
 
392 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  42.9 
 
 
441 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  39.82 
 
 
426 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  40.11 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  40.46 
 
 
429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1195  GTP-binding protein  39.07 
 
 
412 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00118595  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  43.1 
 
 
406 aa  220  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0446  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.09 
 
 
394 aa  220  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  41.89 
 
 
396 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  42.14 
 
 
392 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4759  putative GTPase HflX  42.21 
 
 
426 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4630  putative GTPase HflX  42.21 
 
 
426 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048412  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4723  putative GTPase HflX  42.21 
 
 
426 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  42.48 
 
 
387 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  38.7 
 
 
482 aa  219  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4780  putative GTPase HflX  42.21 
 
 
426 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal  0.331117 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4640  putative GTPase HflX  42.21 
 
 
426 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208484  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  44.55 
 
 
413 aa  219  6e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  43.11 
 
 
422 aa  219  6e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  42.14 
 
 
387 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  42.14 
 
 
387 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  42.14 
 
 
387 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  42.14 
 
 
387 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  42.31 
 
 
435 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.74 
 
 
436 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1231  GTP-binding proten HflX  40.96 
 
 
370 aa  218  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  42.03 
 
 
429 aa  218  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1212  GTP-binding protein HflX  39.46 
 
 
412 aa  217  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1339  GTP-binding protein HflX  42.18 
 
 
387 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  40.59 
 
 
426 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  40.59 
 
 
426 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  42.05 
 
 
428 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  41.33 
 
 
450 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0410  GTP-binding protein HflX  41.99 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  41.99 
 
 
435 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  40.07 
 
 
430 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  39.88 
 
 
439 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  40.51 
 
 
432 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  42.02 
 
 
521 aa  216  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0356  putative GTPase HflX  40.24 
 
 
426 aa  216  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.152366  hitchhiker  0.00466267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  40.65 
 
 
433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  39.31 
 
 
440 aa  215  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  40.29 
 
 
512 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  40.65 
 
 
433 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  39.13 
 
 
429 aa  215  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  41 
 
 
450 aa  215  9e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  39.14 
 
 
522 aa  215  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  40.54 
 
 
426 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  38.57 
 
 
553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  39.03 
 
 
501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4340  GTP-binding protein, HSR1-related  42.98 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436695  normal  0.136604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  41.99 
 
 
435 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>