134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2627 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2627  protein of unknown function UPF0052 and CofD  100 
 
 		 404 aa  808    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3600  hypothetical protein  45.4 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.8 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  hitchhiker  0.000000404226 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2436  protein of unknown function UPF0052 and CofD  47.45 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2698  hypothetical protein  45.22 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1986  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.13 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1907  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45 
 
 		 400 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0878  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.9 
 
 		 473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.13378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1672  hypothetical protein  38.3 
 
 		 405 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1963  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.06 
 
 		 412 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4051  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.33 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160133 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6068  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.91 
 
 		 375 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_2933  predicted protein  28.33 
 
 		 367 aa  119  7.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.924332  normal  0.180994 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.1 
 
 		 438 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.56 
 
 		 437 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  30.53 
 
 		 461 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  29.45 
 
 		 448 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  29.47 
 
 		 461 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.62 
 
 		 324 aa  106  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  29.47 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.71 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  31.91 
 
 		 451 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  29.47 
 
 		 461 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.9 
 
 		 317 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  32.28 
 
 		 496 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.43 
 
 		 323 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.77 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  29.77 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  29.77 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  29.77 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  29.77 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  31.58 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  29.77 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  29.77 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  29.77 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  29.77 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  29.77 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.02 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  31.35 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.95 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  25.75 
 
 		 331 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  25.75 
 
 		 331 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29 
 
 		 457 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  29.67 
 
 		 421 aa  99.8  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  29.22 
 
 		 458 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.77 
 
 		 317 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.7 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  29.57 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  29.18 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  25.8 
 
 		 328 aa  97.4  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.3 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.7 
 
 		 458 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.7 
 
 		 458 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  30.69 
 
 		 469 aa  96.3  9e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  30.26 
 
 		 465 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  30.26 
 
 		 465 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.33 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9153  hypothetical protein  31.47 
 
 		 212 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  28.71 
 
 		 456 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.43 
 
 		 463 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2646  hypothetical protein  29.87 
 
 		 336 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0000683151  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.97 
 
 		 318 aa  92  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  27.48 
 
 		 316 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.87 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.45 
 
 		 330 aa  89.4  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.25 
 
 		 336 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  28.16 
 
 		 444 aa  87.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  29.28 
 
 		 441 aa  87  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.94 
 
 		 336 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.71 
 
 		 311 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.84 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.43 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  28.95 
 
 		 502 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.94 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  28.3 
 
 		 341 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  26.6 
 
 		 322 aa  79.3  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13090  conserved hypothetical protein, cofD-related  26.89 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.603465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.29 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.44 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  27.95 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  27.7 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  25.32 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.45 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03090  hypothetical protein  28.29 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.700154  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  24.21 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0387  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.6 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000030565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.67 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  24.19 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.62 
 
 		 324 aa  67  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  23.38 
 
 		 324 aa  67  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00039  UPF0052 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12650)  27.23 
 
 		 535 aa  66.6  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.757266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  25.08 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2645  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.78 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.61 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1546  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.42 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.566126  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.57 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60952  conserved hypothetical protein  27.01 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.607875 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20050  conserved hypothetical protein, cofD-related protein  25.76 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1254  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.84 
 
 		 317 aa  57  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>