53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60952 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_60952  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  1001    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.607875 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00039  UPF0052 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12650)  39.11 
 
 		 535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.757266  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03090  hypothetical protein  34.66 
 
 		 522 aa  248  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.700154  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_2933  predicted protein  40.47 
 
 		 367 aa  163  7e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.924332  normal  0.180994 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2627  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.96 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.49 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  hitchhiker  0.000000404226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2698  hypothetical protein  27.54 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0878  protein of unknown function UPF0052 and CofD  22.51 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.13378 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3600  hypothetical protein  28.31 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2436  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.27 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4051  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.77 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160133 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1672  hypothetical protein  25.24 
 
 		 405 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1986  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.5 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  27.73 
 
 		 328 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1907  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.77 
 
 		 400 aa  50.4  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  26.27 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  26.27 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  38.46 
 
 		 469 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  37.18 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  37.18 
 
 		 496 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.57 
 
 		 330 aa  47.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  37.18 
 
 		 502 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.33 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.33 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1876  hypothetical protein  37.31 
 
 		 292 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.374483  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  34.62 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.83 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.21 
 
 		 324 aa  45.8  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.42 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  34.62 
 
 		 461 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.22 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1891  hypothetical protein  37.7 
 
 		 296 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0737099  normal  0.0181662 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02955  hypothetical protein  34.43 
 
 		 301 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  35.06 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.05 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.35 
 
 		 457 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  34.62 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.33 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 457 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.27 
 
 		 375 aa  44.7  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 456 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1963  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.21 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0542  hypothetical protein  36.07 
 
 		 296 aa  44.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25 
 
 		 314 aa  44.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0896  hypothetical protein  35.29 
 
 		 314 aa  44.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  27.56 
 
 		 375 aa  44.3  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2436  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.07 
 
 		 311 aa  43.9  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002953  hypothetical protein  32.79 
 
 		 298 aa  44.3  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.133639  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3327  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.46 
 
 		 333 aa  44.3  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  22.82 
 
 		 323 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.58 
 
 		 442 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>