175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0542 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0542  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002953  hypothetical protein  83.33 
 
 		 298 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.133639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02955  hypothetical protein  82.43 
 
 		 301 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1891  hypothetical protein  74.32 
 
 		 296 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0737099  normal  0.0181662 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1876  hypothetical protein  71.38 
 
 		 292 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.374483  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0896  hypothetical protein  51.34 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1956  hypothetical protein  53.42 
 
 		 307 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2120  hypothetical protein  53.42 
 
 		 307 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.385484  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2019  hypothetical protein  53.08 
 
 		 307 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0865555  hitchhiker  0.0000000603841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2351  hypothetical protein  53.47 
 
 		 306 aa  295  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0928  hypothetical protein  54.58 
 
 		 302 aa  295  7e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0642233  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2862  protein of unknown function UPF0052 and CofD  54.58 
 
 		 302 aa  295  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000990783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0803  hypothetical protein  55.22 
 
 		 302 aa  295  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000436595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2572  hypothetical protein  54.58 
 
 		 302 aa  295  8e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000058678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0834  hypothetical protein  54.58 
 
 		 302 aa  295  8e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0843  hypothetical protein  54.58 
 
 		 302 aa  295  8e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00101345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2863  protein of unknown function UPF0052 and CofD  54.58 
 
 		 302 aa  295  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000381637  normal  0.0132805 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00747  predicted transferase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  54.58 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00764  hypothetical protein  54.58 
 
 		 302 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.697988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2412  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.94 
 
 		 300 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.11495  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1272  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.63 
 
 		 302 aa  292  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2224  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.17 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2227  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.36 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000179515  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2157  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.36 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0381242  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4500  hypothetical protein  51.36 
 
 		 312 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2214  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.36 
 
 		 312 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00605686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2207  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.02 
 
 		 312 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00612561  normal  0.259269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2227  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.29 
 
 		 303 aa  288  9e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1960  hypothetical protein  51.58 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.592155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0864  hypothetical protein  53.56 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0895  hypothetical protein  53.56 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0950  hypothetical protein  53.56 
 
 		 302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0927  hypothetical protein  53.56 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0836  hypothetical protein  53.56 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1946  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.85 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1511  hypothetical protein  54.55 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2533  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.9 
 
 		 306 aa  277  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1319  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.72 
 
 		 305 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000691266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2953  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.1 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1804  hypothetical protein  49.48 
 
 		 302 aa  273  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0263222  normal  0.492709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1998  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.76 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2023  hypothetical protein  49.31 
 
 		 318 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.340724  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2837  hypothetical protein  52.68 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1432  hypothetical protein  52.68 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2924  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.68 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333236  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2436  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.35 
 
 		 311 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156918  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2836  hypothetical protein  46.64 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449877  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.93 
 
 		 458 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.93 
 
 		 458 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  35.5 
 
 		 457 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.68 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.83 
 
 		 463 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.27 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  37.02 
 
 		 458 aa  158  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  33.01 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  33.95 
 
 		 456 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.66 
 
 		 442 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.36 
 
 		 443 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  36.6 
 
 		 461 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  36.6 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.41 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.08 
 
 		 428 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.07 
 
 		 438 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.04 
 
 		 326 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  36.17 
 
 		 461 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  34.67 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  37.78 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  38.46 
 
 		 441 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  31.78 
 
 		 448 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  37.78 
 
 		 469 aa  145  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  36.17 
 
 		 461 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.99 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.27 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  36.89 
 
 		 496 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  34.13 
 
 		 365 aa  142  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2019  hypothetical protein  32.58 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  35.25 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.25 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.25 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  30.23 
 
 		 421 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.31 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.16 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  37.44 
 
 		 502 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  35.57 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  34.15 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  34.41 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.33 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  34.41 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.18 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  33.02 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2646  hypothetical protein  35.95 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0000683151  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  35.66 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  32.2 
 
 		 439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.13 
 
 		 358 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  38.43 
 
 		 341 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.75 
 
 		 375 aa  135  8e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  29.49 
 
 		 324 aa  135  9e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.2 
 
 		 317 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.18 
 
 		 336 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  36.53 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>