178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1995 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  622  1e-177  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  80.66 
 
 
311 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2196  protein of unknown function UPF0052 and CofD  75 
 
 
326 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000226578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2019  hypothetical protein  72.22 
 
 
330 aa  425  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3012  protein of unknown function UPF0052 and CofD  73.05 
 
 
324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  67.65 
 
 
337 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2933  protein of unknown function UPF0052 and CofD  67.97 
 
 
358 aa  380  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20050  conserved hypothetical protein, cofD-related protein  64.12 
 
 
321 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17562  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1546  protein of unknown function UPF0052 and CofD  64.03 
 
 
320 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.566126  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2528  protein of unknown function UPF0052 and CofD  62.58 
 
 
330 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5611  protein of unknown function UPF0052 and CofD  64.76 
 
 
428 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.796234  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1254  protein of unknown function UPF0052 and CofD  59.8 
 
 
317 aa  346  3e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1825  protein of unknown function UPF0052 and CofD  57.74 
 
 
339 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  57.38 
 
 
328 aa  326  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1945  protein of unknown function UPF0052 and CofD  61.84 
 
 
325 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69785  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2084  hypothetical protein  56.87 
 
 
339 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0996118  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.41 
 
 
326 aa  311  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  56.58 
 
 
340 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.58 
 
 
340 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.58 
 
 
340 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  59.42 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15180  conserved hypothetical protein, cofD-related  53.31 
 
 
396 aa  306  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  56.58 
 
 
342 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  58.84 
 
 
350 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.58 
 
 
339 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2699  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.25 
 
 
344 aa  295  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.501391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2543  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.9 
 
 
320 aa  293  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11320  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  56.37 
 
 
348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.763396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3327  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.19 
 
 
333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2061  protein of unknown function UPF0052 and CofD  54.9 
 
 
368 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282535  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2044  protein of unknown function UPF0052 and CofD  58.62 
 
 
366 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  52.53 
 
 
308 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1635  hypothetical protein  55.84 
 
 
360 aa  275  6e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.919127  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3100  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.05 
 
 
331 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582963  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2361  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.62 
 
 
337 aa  269  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13090  conserved hypothetical protein, cofD-related  46.91 
 
 
346 aa  253  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.603465  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.54 
 
 
463 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  39.62 
 
 
316 aa  209  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.99 
 
 
453 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  38.12 
 
 
457 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  37.65 
 
 
458 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.8 
 
 
458 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.8 
 
 
458 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  41.34 
 
 
496 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.45 
 
 
428 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  41.64 
 
 
469 aa  196  6e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.92 
 
 
438 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  35.67 
 
 
461 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  35.98 
 
 
461 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  40.56 
 
 
461 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.87 
 
 
457 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  43.02 
 
 
451 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  35.65 
 
 
421 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  41.49 
 
 
461 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.19 
 
 
323 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  38.08 
 
 
456 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  42.32 
 
 
465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  42.32 
 
 
465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.89 
 
 
437 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  34.13 
 
 
439 aa  182  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  34.64 
 
 
502 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  38.15 
 
 
469 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.77 
 
 
317 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  33.86 
 
 
448 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.51 
 
 
442 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  33.24 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  33.23 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  37.6 
 
 
365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.58 
 
 
439 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.02 
 
 
325 aa  172  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  36.92 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  34.48 
 
 
317 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  34.48 
 
 
317 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  34.48 
 
 
317 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  34.48 
 
 
317 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.8 
 
 
317 aa  172  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  34.48 
 
 
317 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.74 
 
 
375 aa  170  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  34.48 
 
 
317 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  34.48 
 
 
317 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.62 
 
 
317 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  34.17 
 
 
317 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.66 
 
 
388 aa  169  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  34.17 
 
 
317 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.65 
 
 
434 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.84 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  39.3 
 
 
321 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  37.45 
 
 
327 aa  166  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  37.6 
 
 
324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  38.08 
 
 
446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  37.02 
 
 
324 aa  163  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.5 
 
 
314 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.33 
 
 
330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.96 
 
 
358 aa  162  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.89 
 
 
314 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.69 
 
 
310 aa  160  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.17 
 
 
324 aa  159  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  33.96 
 
 
331 aa  158  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  33.96 
 
 
331 aa  158  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.23 
 
 
336 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>