190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0114 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  893    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  58.14 
 
 
434 aa  497  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  63.29 
 
 
324 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.98 
 
 
438 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  58.77 
 
 
448 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  55.52 
 
 
421 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  47.42 
 
 
428 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.03 
 
 
358 aa  363  3e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.23 
 
 
442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  54.14 
 
 
388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.03 
 
 
457 aa  319  7e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.8 
 
 
453 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  49.69 
 
 
316 aa  309  5.9999999999999995e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  47.16 
 
 
446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.47 
 
 
463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  42.86 
 
 
461 aa  306  3e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  42.76 
 
 
458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.24 
 
 
458 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.24 
 
 
458 aa  305  7e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.52 
 
 
323 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  47.54 
 
 
451 aa  302  8.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  47.15 
 
 
461 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  51.06 
 
 
461 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  51.51 
 
 
461 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.37 
 
 
437 aa  298  9e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  47.54 
 
 
496 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  46.11 
 
 
469 aa  297  3e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.54 
 
 
317 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.43 
 
 
317 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  41.63 
 
 
456 aa  294  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.11 
 
 
317 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  48.66 
 
 
465 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  44.39 
 
 
502 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  48.66 
 
 
465 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  47 
 
 
331 aa  292  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  47 
 
 
331 aa  292  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  48.17 
 
 
469 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  48.11 
 
 
317 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  48.11 
 
 
317 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  48.11 
 
 
317 aa  290  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  47.73 
 
 
457 aa  288  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  47.8 
 
 
317 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  47.48 
 
 
317 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  47.8 
 
 
317 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  47.8 
 
 
317 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  47.8 
 
 
317 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  47.8 
 
 
317 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  47.19 
 
 
325 aa  286  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.85 
 
 
330 aa  280  4e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  47.55 
 
 
375 aa  278  9e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  45.57 
 
 
328 aa  277  3e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.74 
 
 
314 aa  276  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.9 
 
 
314 aa  275  8e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.18 
 
 
439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  40.77 
 
 
341 aa  272  9e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.86 
 
 
311 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.94 
 
 
318 aa  263  4.999999999999999e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.8 
 
 
324 aa  250  3e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  40.37 
 
 
441 aa  249  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  42.12 
 
 
321 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.85 
 
 
310 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.28 
 
 
350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  39.51 
 
 
365 aa  234  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  40.68 
 
 
327 aa  231  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  41.05 
 
 
444 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  38.51 
 
 
322 aa  224  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.91 
 
 
443 aa  224  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0387  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.25 
 
 
328 aa  222  8e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000030565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.75 
 
 
339 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  37.07 
 
 
327 aa  219  8.999999999999998e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  36.73 
 
 
324 aa  217  4e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  35.94 
 
 
324 aa  211  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  42.75 
 
 
375 aa  210  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1782  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.73 
 
 
374 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10630  conserved hypothetical protein, cofD-related  38.16 
 
 
384 aa  194  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.535112  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.66 
 
 
336 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  33.71 
 
 
340 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.71 
 
 
340 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.71 
 
 
340 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.2 
 
 
328 aa  183  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.33 
 
 
336 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  34.13 
 
 
317 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2646  hypothetical protein  35.37 
 
 
336 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0000683151  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2019  hypothetical protein  32.24 
 
 
330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.33 
 
 
311 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.75 
 
 
326 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  32.47 
 
 
342 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2699  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.06 
 
 
344 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.501391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2645  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.23 
 
 
341 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  32.52 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20050  conserved hypothetical protein, cofD-related protein  35.33 
 
 
321 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17562  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  36.36 
 
 
323 aa  166  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  32.35 
 
 
337 aa  166  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.05 
 
 
339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.82 
 
 
350 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2196  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.95 
 
 
326 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000226578  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2933  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.8 
 
 
358 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2361  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.46 
 
 
337 aa  162  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1635  hypothetical protein  37.32 
 
 
360 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.919127  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.17 
 
 
341 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>