178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3012 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3012  protein of unknown function UPF0052 and CofD  100 
 
 		 324 aa  632  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2019  hypothetical protein  81.47 
 
 		 330 aa  502  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2196  protein of unknown function UPF0052 and CofD  74.13 
 
 		 326 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000226578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  74.59 
 
 		 311 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  73.05 
 
 		 317 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  70.23 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2933  protein of unknown function UPF0052 and CofD  66.02 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20050  conserved hypothetical protein, cofD-related protein  63.52 
 
 		 321 aa  371  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1254  protein of unknown function UPF0052 and CofD  60.59 
 
 		 317 aa  354  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2528  protein of unknown function UPF0052 and CofD  59.31 
 
 		 330 aa  352  5e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1546  protein of unknown function UPF0052 and CofD  60 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.566126  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  62.82 
 
 		 323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  57.61 
 
 		 326 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5611  protein of unknown function UPF0052 and CofD  61.18 
 
 		 428 aa  329  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.796234  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1945  protein of unknown function UPF0052 and CofD  59.49 
 
 		 325 aa  325  8.000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1825  protein of unknown function UPF0052 and CofD  54.49 
 
 		 339 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.73 
 
 		 328 aa  319  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2084  hypothetical protein  54.78 
 
 		 339 aa  319  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0996118  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  55.52 
 
 		 340 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.52 
 
 		 340 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.52 
 
 		 340 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15180  conserved hypothetical protein, cofD-related  52.87 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1635  hypothetical protein  55.42 
 
 		 360 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.919127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2699  protein of unknown function UPF0052 and CofD  57.14 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.501391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.52 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2061  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.31 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  55.23 
 
 		 342 aa  300  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  57.37 
 
 		 350 aa  299  5e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3327  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.45 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3100  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.88 
 
 		 331 aa  285  7e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582963  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2044  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.59 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11320  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  51.55 
 
 		 348 aa  281  7.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.763396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13090  conserved hypothetical protein, cofD-related  49.25 
 
 		 346 aa  279  4e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.603465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2361  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.7 
 
 		 337 aa  275  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2543  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.63 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  49.68 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  37.54 
 
 		 316 aa  205  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.01 
 
 		 463 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.84 
 
 		 453 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.11 
 
 		 458 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.11 
 
 		 458 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.57 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  35.26 
 
 		 457 aa  195  9e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.54 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.39 
 
 		 457 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  34.35 
 
 		 458 aa  189  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  35.05 
 
 		 421 aa  188  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  34.86 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  34.56 
 
 		 461 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  33.99 
 
 		 502 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  37.54 
 
 		 469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  34.05 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.76 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  38.01 
 
 		 327 aa  183  3e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  34.14 
 
 		 461 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  37.19 
 
 		 456 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  39.69 
 
 		 451 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  36.17 
 
 		 496 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.16 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  36.19 
 
 		 448 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.23 
 
 		 437 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  34.95 
 
 		 465 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.53 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  34.95 
 
 		 465 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.64 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  31.9 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  35.56 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  36.92 
 
 		 469 aa  172  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  37.74 
 
 		 365 aa  172  7.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.28 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  38.54 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.91 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  33.64 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.33 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  36.12 
 
 		 317 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  36.12 
 
 		 317 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.91 
 
 		 438 aa  169  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  37.6 
 
 		 317 aa  168  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.55 
 
 		 358 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  34.91 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.68 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.37 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  31.5 
 
 		 439 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.67 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.96 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  36.05 
 
 		 446 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.12 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  35.5 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  31.67 
 
 		 341 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.58 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.08 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  32.83 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  32.83 
 
 		 331 aa  156  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.5 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.5 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>