194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0263 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  634    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.19 
 
 
428 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.85 
 
 
457 aa  334  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.99 
 
 
442 aa  330  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  49.68 
 
 
421 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.92 
 
 
388 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50 
 
 
323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  52.79 
 
 
446 aa  312  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  49.69 
 
 
439 aa  309  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.52 
 
 
317 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.25 
 
 
463 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  47.8 
 
 
438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.84 
 
 
317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.21 
 
 
458 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.21 
 
 
458 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  49.52 
 
 
317 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  49.52 
 
 
317 aa  300  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.2 
 
 
317 aa  299  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  48.88 
 
 
317 aa  299  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  48.56 
 
 
317 aa  297  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  48.56 
 
 
317 aa  296  4e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  48.56 
 
 
317 aa  295  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  48.56 
 
 
317 aa  295  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  48.56 
 
 
317 aa  295  5e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  48.56 
 
 
317 aa  295  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.53 
 
 
437 aa  295  9e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  47.92 
 
 
324 aa  294  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.52 
 
 
325 aa  293  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.05 
 
 
434 aa  292  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.42 
 
 
375 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  46.62 
 
 
457 aa  287  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.03 
 
 
453 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.14 
 
 
358 aa  278  6e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  43.63 
 
 
331 aa  278  9e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  43.63 
 
 
331 aa  278  9e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  47.42 
 
 
456 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  46.5 
 
 
448 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  46.03 
 
 
458 aa  275  6e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  47.12 
 
 
341 aa  275  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  45.77 
 
 
461 aa  274  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.75 
 
 
330 aa  273  3e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  45.14 
 
 
461 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  47.47 
 
 
469 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  45.91 
 
 
461 aa  268  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  44.65 
 
 
461 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  46.1 
 
 
321 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  43.51 
 
 
441 aa  264  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  41.29 
 
 
328 aa  262  6e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  43.75 
 
 
469 aa  262  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.57 
 
 
314 aa  259  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.09 
 
 
314 aa  257  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  43.12 
 
 
496 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  43.44 
 
 
451 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  41.88 
 
 
502 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.85 
 
 
324 aa  246  3e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  43.75 
 
 
465 aa  245  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  43.75 
 
 
465 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.13 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  40.5 
 
 
365 aa  241  1e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.23 
 
 
439 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.38 
 
 
443 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.68 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.47 
 
 
311 aa  235  6e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  45.31 
 
 
324 aa  230  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.28 
 
 
318 aa  229  4e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.56 
 
 
350 aa  229  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  38.99 
 
 
327 aa  226  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  38.98 
 
 
327 aa  224  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0387  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.19 
 
 
328 aa  223  4e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000030565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  37.42 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.35 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.02 
 
 
336 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  37.78 
 
 
322 aa  216  5.9999999999999996e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20050  conserved hypothetical protein, cofD-related protein  39.94 
 
 
321 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17562  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  39.62 
 
 
317 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.46 
 
 
311 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2646  hypothetical protein  42.35 
 
 
336 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0000683151  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2019  hypothetical protein  40 
 
 
330 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  37.26 
 
 
337 aa  203  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  40.13 
 
 
444 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  34.43 
 
 
375 aa  199  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.15 
 
 
326 aa  199  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2528  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.27 
 
 
330 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  41.31 
 
 
342 aa  197  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1254  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.93 
 
 
317 aa  195  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2196  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.36 
 
 
326 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000226578  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  40.38 
 
 
340 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.38 
 
 
340 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.38 
 
 
340 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2933  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.35 
 
 
358 aa  192  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1782  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.25 
 
 
374 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.55 
 
 
328 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.93 
 
 
339 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.47 
 
 
350 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1546  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.67 
 
 
320 aa  188  9e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.566126  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  36.73 
 
 
323 aa  188  9e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  38.91 
 
 
308 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2699  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.54 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.501391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3012  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.54 
 
 
324 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10630  conserved hypothetical protein, cofD-related  40.32 
 
 
384 aa  180  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.535112  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>