189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3053 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  100 
 
 		 442 aa  896    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.52 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.05 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  50.59 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  47.52 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  47.78 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  48.12 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.58 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.86 
 
 		 463 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.08 
 
 		 453 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  45.23 
 
 		 439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  45.67 
 
 		 457 aa  356  5e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.79 
 
 		 458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.79 
 
 		 458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.5 
 
 		 434 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.55 
 
 		 438 aa  350  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  46.08 
 
 		 469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  45.43 
 
 		 448 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  44.94 
 
 		 461 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  44.06 
 
 		 461 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  43.49 
 
 		 502 aa  333  5e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.85 
 
 		 324 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  53.99 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  43.56 
 
 		 461 aa  330  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.72 
 
 		 388 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  44.06 
 
 		 461 aa  318  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.32 
 
 		 323 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  42.22 
 
 		 465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  43.02 
 
 		 469 aa  310  4e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  42.86 
 
 		 451 aa  309  6.999999999999999e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  42.23 
 
 		 465 aa  307  3e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.36 
 
 		 317 aa  307  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50 
 
 		 317 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  49.36 
 
 		 317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  49.36 
 
 		 317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  49.36 
 
 		 317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  49.36 
 
 		 317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  49.36 
 
 		 317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  49.36 
 
 		 317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  49.36 
 
 		 317 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  42.63 
 
 		 496 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.41 
 
 		 358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  49.68 
 
 		 317 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  49.04 
 
 		 317 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  47.42 
 
 		 331 aa  300  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  47.42 
 
 		 331 aa  300  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50 
 
 		 325 aa  298  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.19 
 
 		 317 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.04 
 
 		 375 aa  296  7e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.67 
 
 		 439 aa  295  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  47.42 
 
 		 328 aa  292  6e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  40.62 
 
 		 441 aa  292  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  45.4 
 
 		 341 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.46 
 
 		 330 aa  282  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  39.44 
 
 		 444 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.76 
 
 		 443 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.96 
 
 		 314 aa  268  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.79 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  46.43 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.86 
 
 		 311 aa  262  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.93 
 
 		 310 aa  256  7e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  40.68 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.39 
 
 		 318 aa  245  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.96 
 
 		 324 aa  244  3e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.56 
 
 		 350 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0387  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.5 
 
 		 328 aa  224  3e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000030565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  38.99 
 
 		 322 aa  218  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  38.17 
 
 		 327 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  42.53 
 
 		 324 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  38.89 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.51 
 
 		 339 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  35.94 
 
 		 375 aa  208  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  37.92 
 
 		 324 aa  205  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.91 
 
 		 336 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.91 
 
 		 336 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  38.41 
 
 		 323 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2646  hypothetical protein  40.98 
 
 		 336 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0000683151  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.94 
 
 		 326 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10630  conserved hypothetical protein, cofD-related  36.44 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.535112  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.3 
 
 		 350 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  35.4 
 
 		 337 aa  188  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.91 
 
 		 328 aa  187  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  42.8 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1782  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.24 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.28 
 
 		 311 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  39.93 
 
 		 342 aa  183  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.15 
 
 		 339 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2019  hypothetical protein  35.88 
 
 		 330 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2543  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.09 
 
 		 320 aa  179  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  37.88 
 
 		 340 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.88 
 
 		 340 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  35.51 
 
 		 317 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.88 
 
 		 340 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2361  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.03 
 
 		 337 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2933  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.53 
 
 		 358 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2528  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.95 
 
 		 330 aa  173  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2699  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.96 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.501391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1546  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.81 
 
 		 320 aa  170  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.566126  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13090  conserved hypothetical protein, cofD-related  36.46 
 
 		 346 aa  169  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.603465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2084  hypothetical protein  35.54 
 
 		 339 aa  169  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0996118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>