177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1635 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1635  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  692    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.919127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2061  protein of unknown function UPF0052 and CofD  73.63 
 
 		 368 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  59.74 
 
 		 337 aa  343  4e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2196  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.65 
 
 		 326 aa  325  5e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000226578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2019  hypothetical protein  55.02 
 
 		 330 aa  322  7e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.86 
 
 		 311 aa  315  8e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3012  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.42 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2933  protein of unknown function UPF0052 and CofD  57.74 
 
 		 358 aa  309  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20050  conserved hypothetical protein, cofD-related protein  54.63 
 
 		 321 aa  306  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  55.84 
 
 		 317 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.87 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.15 
 
 		 328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  54.94 
 
 		 350 aa  302  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5611  protein of unknown function UPF0052 and CofD  58.62 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.796234  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1546  protein of unknown function UPF0052 and CofD  54.6 
 
 		 320 aa  294  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.566126  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1825  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.38 
 
 		 339 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  56.19 
 
 		 323 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1254  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.95 
 
 		 317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  50.15 
 
 		 340 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.15 
 
 		 340 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.15 
 
 		 340 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2528  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.52 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2699  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.96 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.501391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.7 
 
 		 339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1945  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.35 
 
 		 325 aa  283  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  51.78 
 
 		 342 aa  279  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2084  hypothetical protein  50.48 
 
 		 339 aa  279  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0996118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3100  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.31 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582963  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2543  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.32 
 
 		 320 aa  272  8.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15180  conserved hypothetical protein, cofD-related  51.28 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3327  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.62 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  52.41 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2044  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.56 
 
 		 366 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2361  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.85 
 
 		 337 aa  252  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11320  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  50.65 
 
 		 348 aa  236  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.763396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13090  conserved hypothetical protein, cofD-related  42.46 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.603465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.3 
 
 		 463 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.75 
 
 		 458 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.75 
 
 		 458 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  41.22 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  40.5 
 
 		 457 aa  193  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.14 
 
 		 453 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  37.27 
 
 		 458 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.63 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  34.8 
 
 		 461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.59 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.29 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.28 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  34.8 
 
 		 461 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  39.71 
 
 		 451 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.85 
 
 		 457 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  34.5 
 
 		 461 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.07 
 
 		 428 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  33.73 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  39.84 
 
 		 461 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  40.7 
 
 		 469 aa  177  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.91 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  40.39 
 
 		 496 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  37.32 
 
 		 439 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  38.3 
 
 		 456 aa  175  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.96 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  39.03 
 
 		 502 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.38 
 
 		 439 aa  172  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.88 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.89 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  40.73 
 
 		 465 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  35.5 
 
 		 465 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  42.05 
 
 		 469 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.42 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  38.46 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  38.46 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  38.46 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  38.46 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  36.4 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  38.46 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  38.46 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  38.46 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.85 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.71 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.1 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  37.73 
 
 		 317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  37.73 
 
 		 317 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  41.8 
 
 		 321 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  35.31 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.18 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.69 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.85 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  36.26 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  35.38 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  35.66 
 
 		 324 aa  160  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  35.02 
 
 		 441 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.75 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.79 
 
 		 443 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.46 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.86 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.2 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.93 
 
 		 330 aa  155  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  41.48 
 
 		 446 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.79 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  31.03 
 
 		 365 aa  152  7e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>