184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2959 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  894    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  63.98 
 
 		 443 aa  524  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.24 
 
 		 428 aa  318  9e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.62 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.01 
 
 		 457 aa  295  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  44.79 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.44 
 
 		 463 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  39.57 
 
 		 458 aa  277  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.39 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  39.78 
 
 		 457 aa  276  6e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.5 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.5 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.45 
 
 		 388 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  38.98 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  38.85 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  37.76 
 
 		 461 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.17 
 
 		 434 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  43.51 
 
 		 316 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  37.39 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  37.24 
 
 		 465 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  37.21 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  36.9 
 
 		 465 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.55 
 
 		 323 aa  256  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.87 
 
 		 438 aa  255  9e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  37.79 
 
 		 502 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  36.57 
 
 		 461 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.08 
 
 		 437 aa  253  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  34.37 
 
 		 439 aa  250  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  38.41 
 
 		 496 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.94 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  42.53 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.41 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  38.63 
 
 		 469 aa  243  7e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.34 
 
 		 439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.23 
 
 		 325 aa  237  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  39.95 
 
 		 451 aa  236  4e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  34.2 
 
 		 448 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.14 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  42.05 
 
 		 317 aa  236  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  41.46 
 
 		 341 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  40.95 
 
 		 317 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.18 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.08 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.38 
 
 		 330 aa  232  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40 
 
 		 317 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  230  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  36.04 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.36 
 
 		 324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  36.64 
 
 		 446 aa  221  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.19 
 
 		 314 aa  221  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  38.85 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.74 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.56 
 
 		 311 aa  216  8e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  40.28 
 
 		 331 aa  212  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  40.28 
 
 		 331 aa  212  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.51 
 
 		 339 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.42 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  35.85 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0387  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.22 
 
 		 328 aa  190  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000030565  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.78 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  33.23 
 
 		 327 aa  188  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.04 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.65 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  34.07 
 
 		 324 aa  184  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.94 
 
 		 350 aa  183  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2646  hypothetical protein  40.31 
 
 		 336 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0000683151  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  35.31 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  32.8 
 
 		 327 aa  168  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  30.72 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  34.69 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.69 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.69 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  34.06 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  37.39 
 
 		 375 aa  154  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2084  hypothetical protein  34.73 
 
 		 339 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0996118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2019  hypothetical protein  34.38 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  34.62 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.67 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  35.44 
 
 		 337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.23 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.96 
 
 		 339 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1825  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.86 
 
 		 339 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979333 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0542  hypothetical protein  38.46 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1254  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.19 
 
 		 317 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20050  conserved hypothetical protein, cofD-related protein  34.31 
 
 		 321 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10630  conserved hypothetical protein, cofD-related  35.71 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.535112  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2836  hypothetical protein  35.29 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449877  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  33.96 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02955  hypothetical protein  38.1 
 
 		 301 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.01 
 
 		 311 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2412  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.5 
 
 		 300 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.11495  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002953  hypothetical protein  37.7 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.133639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.59 
 
 		 350 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1546  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.81 
 
 		 320 aa  141  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.566126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>