180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1254 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1254  protein of unknown function UPF0052 and CofD  100 
 
 		 317 aa  622  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20050  conserved hypothetical protein, cofD-related protein  73.16 
 
 		 321 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1945  protein of unknown function UPF0052 and CofD  70.51 
 
 		 325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1546  protein of unknown function UPF0052 and CofD  67.96 
 
 		 320 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.566126  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2933  protein of unknown function UPF0052 and CofD  68.08 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1825  protein of unknown function UPF0052 and CofD  60 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  61.18 
 
 		 311 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2084  hypothetical protein  61.02 
 
 		 339 aa  363  3e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0996118  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  60.9 
 
 		 328 aa  360  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  59.8 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15180  conserved hypothetical protein, cofD-related  57.05 
 
 		 396 aa  346  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2019  hypothetical protein  60.91 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2196  protein of unknown function UPF0052 and CofD  57.59 
 
 		 326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000226578  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  58.52 
 
 		 337 aa  338  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3012  protein of unknown function UPF0052 and CofD  60.59 
 
 		 324 aa  332  6e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2528  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.95 
 
 		 330 aa  326  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  51.09 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.09 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.09 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5611  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.65 
 
 		 428 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.796234  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2699  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.96 
 
 		 344 aa  291  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.501391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.97 
 
 		 339 aa  291  8e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  51.54 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11320  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  51.59 
 
 		 348 aa  281  8.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.763396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13090  conserved hypothetical protein, cofD-related  47.48 
 
 		 346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.603465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  51.61 
 
 		 323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2543  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.65 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  54.98 
 
 		 350 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2061  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.95 
 
 		 368 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.84 
 
 		 326 aa  262  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1635  hypothetical protein  51.95 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.919127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3327  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.48 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3100  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.55 
 
 		 331 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582963  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  48.21 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2361  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.36 
 
 		 337 aa  245  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2044  protein of unknown function UPF0052 and CofD  47.08 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  40.93 
 
 		 316 aa  195  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.1 
 
 		 463 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.42 
 
 		 458 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.42 
 
 		 458 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.78 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  35.69 
 
 		 421 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.85 
 
 		 317 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.38 
 
 		 437 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  35.33 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  38.89 
 
 		 469 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  37.21 
 
 		 327 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.9 
 
 		 428 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.15 
 
 		 453 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  35.58 
 
 		 458 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  39.1 
 
 		 451 aa  170  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  35.26 
 
 		 496 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  33.87 
 
 		 317 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.27 
 
 		 325 aa  168  9e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.26 
 
 		 457 aa  168  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  39 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  39 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  37.94 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  37.94 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  37.94 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  37.94 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  37.94 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  32.61 
 
 		 461 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  33.13 
 
 		 461 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.94 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  37.94 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.34 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  33.96 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  37.11 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  32.71 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  31.52 
 
 		 461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.33 
 
 		 442 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  34.56 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  37.34 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  34.56 
 
 		 465 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  35.98 
 
 		 469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  35.07 
 
 		 448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  34.73 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  34.94 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  32.42 
 
 		 502 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  35.99 
 
 		 456 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40 
 
 		 339 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.61 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  37.94 
 
 		 446 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.71 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.75 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  34.22 
 
 		 365 aa  155  6e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.46 
 
 		 438 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  35.32 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  35.32 
 
 		 331 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.85 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.08 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  34.92 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.47 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  32.95 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.41 
 
 		 443 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.89 
 
 		 439 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  32.95 
 
 		 439 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.72 
 
 		 314 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.59 
 
 		 350 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>