193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0434 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  669    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  79.57 
 
 		 331 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  79.57 
 
 		 331 aa  543  1e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  51.29 
 
 		 317 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.29 
 
 		 317 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  51.29 
 
 		 317 aa  322  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  50.97 
 
 		 317 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  50.97 
 
 		 317 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  50.97 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  50.97 
 
 		 317 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  50.97 
 
 		 317 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.32 
 
 		 317 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  50.65 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  50.32 
 
 		 317 aa  318  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.48 
 
 		 323 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.87 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  47.42 
 
 		 421 aa  308  5.9999999999999995e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.69 
 
 		 388 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  47.42 
 
 		 442 aa  292  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  48.71 
 
 		 446 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.79 
 
 		 457 aa  289  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.66 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.06 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  45.57 
 
 		 439 aa  277  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.48 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  44.23 
 
 		 457 aa  271  8.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.48 
 
 		 434 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  44.73 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.18 
 
 		 458 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.18 
 
 		 458 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.23 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  44.73 
 
 		 461 aa  268  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  44.87 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  44.41 
 
 		 461 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.3 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  43.09 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  44.73 
 
 		 461 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  41.29 
 
 		 316 aa  262  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.73 
 
 		 324 aa  262  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.67 
 
 		 375 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.65 
 
 		 314 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  44.01 
 
 		 469 aa  258  7e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.34 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.67 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  40.51 
 
 		 448 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  43.55 
 
 		 451 aa  252  6e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.72 
 
 		 358 aa  248  8e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  42.58 
 
 		 502 aa  248  9e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  42.58 
 
 		 469 aa  247  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.36 
 
 		 325 aa  245  6.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.31 
 
 		 437 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.68 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.94 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  41.29 
 
 		 496 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  39.68 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  44.67 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  44.67 
 
 		 465 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.32 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  36.76 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.72 
 
 		 439 aa  223  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.63 
 
 		 443 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  38.85 
 
 		 441 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.65 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  34.82 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  36.62 
 
 		 327 aa  206  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  37.34 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  36.96 
 
 		 365 aa  206  7e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  39.56 
 
 		 322 aa  205  1e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.54 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  41.11 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0387  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.66 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000030565  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  39.55 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.89 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.25 
 
 		 336 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  32.94 
 
 		 375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2646  hypothetical protein  35.92 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0000683151  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1782  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.31 
 
 		 374 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  37.8 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1403  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.93 
 
 		 338 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0067064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  37.8 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.8 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.8 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  31.51 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.32 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1804  hypothetical protein  35.25 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0263222  normal  0.492709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.72 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1956  hypothetical protein  34.04 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2120  hypothetical protein  34.04 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.385484  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2645  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.21 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2351  hypothetical protein  33.69 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2019  hypothetical protein  33.69 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0865555  hitchhiker  0.0000000603841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2361  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.41 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2227  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.45 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10630  conserved hypothetical protein, cofD-related  35.54 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.535112  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.98 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.36 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  34.53 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.38 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2224  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.56 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1998  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.86 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>