176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10630 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_10630  conserved hypothetical protein, cofD-related  100 
 
 
384 aa  784    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.535112  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1782  protein of unknown function UPF0052 and CofD  58.49 
 
 
374 aa  410  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  52.57 
 
 
375 aa  359  4e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.71 
 
 
428 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  38.16 
 
 
439 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.15 
 
 
434 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.31 
 
 
457 aa  192  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.44 
 
 
442 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.42 
 
 
324 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  35.17 
 
 
421 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  42.02 
 
 
457 aa  183  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  37.92 
 
 
341 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.37 
 
 
463 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.7 
 
 
453 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  40.32 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  37.65 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.35 
 
 
438 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  41.45 
 
 
461 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  41.45 
 
 
461 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  41.03 
 
 
461 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.31 
 
 
458 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  41.41 
 
 
456 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  40.6 
 
 
461 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.31 
 
 
458 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.75 
 
 
358 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.2 
 
 
323 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.02 
 
 
388 aa  176  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  35.8 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.21 
 
 
437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.23 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41 
 
 
317 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.23 
 
 
314 aa  173  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.2 
 
 
330 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.43 
 
 
317 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.37 
 
 
350 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  39.37 
 
 
317 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  42.55 
 
 
469 aa  170  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  42.13 
 
 
451 aa  170  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  37.65 
 
 
446 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  37.36 
 
 
448 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  40.68 
 
 
458 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  40.59 
 
 
317 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  40.59 
 
 
317 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41 
 
 
317 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  40.59 
 
 
317 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  40.59 
 
 
317 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  40.59 
 
 
317 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  40.59 
 
 
317 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  40.59 
 
 
317 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  40.59 
 
 
317 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  40.85 
 
 
502 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.29 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.23 
 
 
311 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  37.36 
 
 
331 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  37.36 
 
 
331 aa  164  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  40.43 
 
 
496 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  39.52 
 
 
465 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  37.7 
 
 
327 aa  162  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  39.52 
 
 
465 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.38 
 
 
375 aa  162  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.98 
 
 
439 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  36.63 
 
 
324 aa  160  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.33 
 
 
339 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.83 
 
 
443 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  37.4 
 
 
321 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.49 
 
 
324 aa  156  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  35.54 
 
 
328 aa  155  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  41.53 
 
 
469 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.19 
 
 
318 aa  152  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  35.39 
 
 
324 aa  150  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  34.25 
 
 
327 aa  150  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.97 
 
 
310 aa  149  8e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  36.76 
 
 
308 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  37.2 
 
 
337 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.02 
 
 
328 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  31.16 
 
 
441 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  35.42 
 
 
444 aa  143  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.83 
 
 
336 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20050  conserved hypothetical protein, cofD-related protein  36.89 
 
 
321 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17562  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2933  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.95 
 
 
358 aa  139  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.23 
 
 
336 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2019  hypothetical protein  33.46 
 
 
330 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2646  hypothetical protein  32.24 
 
 
336 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0000683151  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0387  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.58 
 
 
328 aa  138  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000030565  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15180  conserved hypothetical protein, cofD-related  31.83 
 
 
396 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2528  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.4 
 
 
330 aa  136  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  35.16 
 
 
342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2543  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.78 
 
 
320 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  34.73 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.9 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.73 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.73 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  36.1 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1945  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.64 
 
 
325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69785  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  37.15 
 
 
323 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.25 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13090  conserved hypothetical protein, cofD-related  32.39 
 
 
346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.603465  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1546  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.26 
 
 
320 aa  130  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.566126  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.35 
 
 
339 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36 
 
 
326 aa  129  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>