187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1374 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  100 
 
 		 310 aa  610  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.97 
 
 		 311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.05 
 
 		 318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.13 
 
 		 314 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.49 
 
 		 314 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.14 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.93 
 
 		 442 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  44.59 
 
 		 421 aa  255  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.6 
 
 		 428 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.48 
 
 		 438 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.09 
 
 		 434 aa  250  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.72 
 
 		 375 aa  249  6e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.43 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  42.67 
 
 		 331 aa  245  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  42.67 
 
 		 331 aa  245  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.36 
 
 		 388 aa  244  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  42.68 
 
 		 328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  45.13 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  43.85 
 
 		 439 aa  242  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.95 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.81 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.08 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.51 
 
 		 325 aa  235  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.43 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  43.41 
 
 		 446 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  42.68 
 
 		 461 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  41.77 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.94 
 
 		 463 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  39.82 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  43.22 
 
 		 461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  42.49 
 
 		 457 aa  225  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  42.31 
 
 		 456 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.08 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  41.14 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  40.76 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  40.76 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  40.76 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  40.76 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  40.76 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.85 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.89 
 
 		 317 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  42.06 
 
 		 461 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  41.14 
 
 		 317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  40.76 
 
 		 317 aa  222  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.12 
 
 		 458 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  43.57 
 
 		 465 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  41.74 
 
 		 461 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  43.89 
 
 		 465 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.12 
 
 		 458 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  38.87 
 
 		 451 aa  218  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  38.82 
 
 		 469 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.07 
 
 		 358 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  42.9 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.78 
 
 		 350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.04 
 
 		 437 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  41.73 
 
 		 496 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  41.64 
 
 		 448 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  41.22 
 
 		 502 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  39.68 
 
 		 458 aa  209  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  38.34 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  36.9 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.76 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  36.42 
 
 		 441 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  37.04 
 
 		 365 aa  195  8.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  38.58 
 
 		 444 aa  195  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.94 
 
 		 439 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0387  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.64 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000030565  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  39.08 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.45 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.64 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  36.4 
 
 		 324 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  38.93 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  36.15 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.07 
 
 		 443 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2646  hypothetical protein  35.27 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0000683151  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1782  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.6 
 
 		 374 aa  168  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  34.67 
 
 		 308 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  37.25 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1998  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.51 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2224  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.38 
 
 		 299 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  32.69 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2227  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.74 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2351  hypothetical protein  36.07 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2412  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.2 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.11495  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2019  hypothetical protein  36.07 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0865555  hitchhiker  0.0000000603841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1956  hypothetical protein  36.07 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2120  hypothetical protein  36.07 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.385484  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  30.49 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.49 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.49 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1946  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.54 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4500  hypothetical protein  35 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2214  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00605686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2227  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000179515  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2157  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0381242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2207  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.42 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00612561  normal  0.259269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.46 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.65 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3327  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.67 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10630  conserved hypothetical protein, cofD-related  33.97 
 
 		 384 aa  149  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.535112  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>