182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2173 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2173  protein of unknown function UPF0052 and CofD  100 
 
 
328 aa  627  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20050  conserved hypothetical protein, cofD-related protein  64.1 
 
 
321 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17562  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1546  protein of unknown function UPF0052 and CofD  63.49 
 
 
320 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.566126  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1254  protein of unknown function UPF0052 and CofD  60.9 
 
 
317 aa  360  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1945  protein of unknown function UPF0052 and CofD  61.86 
 
 
325 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69785  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2933  protein of unknown function UPF0052 and CofD  62.26 
 
 
358 aa  338  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  58.09 
 
 
311 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  58.79 
 
 
337 aa  330  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1825  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.83 
 
 
339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  57.38 
 
 
317 aa  326  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2084  hypothetical protein  56.51 
 
 
339 aa  322  4e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0996118  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15180  conserved hypothetical protein, cofD-related  53.65 
 
 
396 aa  316  3e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2019  hypothetical protein  54.95 
 
 
330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2196  protein of unknown function UPF0052 and CofD  56.33 
 
 
326 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000226578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3012  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.73 
 
 
324 aa  295  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.173158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2528  protein of unknown function UPF0052 and CofD  54.58 
 
 
330 aa  295  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  54.58 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  54.58 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  54.58 
 
 
340 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13090  conserved hypothetical protein, cofD-related  53.82 
 
 
346 aa  288  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.603465  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5611  protein of unknown function UPF0052 and CofD  57.55 
 
 
428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.796234  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  54.64 
 
 
342 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2699  protein of unknown function UPF0052 and CofD  54.25 
 
 
344 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.501391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.29 
 
 
339 aa  275  9e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1635  hypothetical protein  56.15 
 
 
360 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.919127  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3327  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.65 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11320  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  53.02 
 
 
348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.763396  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  53.46 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2543  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.12 
 
 
320 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2061  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.34 
 
 
368 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282535  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5204  protein of unknown function UPF0052 and CofD  54.09 
 
 
350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.32 
 
 
326 aa  258  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3100  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.16 
 
 
331 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582963  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2361  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.62 
 
 
337 aa  249  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  50 
 
 
308 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2044  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.23 
 
 
366 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.42 
 
 
463 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.85 
 
 
457 aa  203  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  38.27 
 
 
421 aa  202  5e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.97 
 
 
323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  36.7 
 
 
457 aa  199  3.9999999999999996e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  35.98 
 
 
458 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.16 
 
 
458 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.16 
 
 
458 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.46 
 
 
428 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  37.66 
 
 
317 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  38.61 
 
 
317 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.29 
 
 
317 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.61 
 
 
317 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  37.66 
 
 
317 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  37.66 
 
 
317 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  35.11 
 
 
461 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  37.66 
 
 
317 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  37.66 
 
 
317 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  37.66 
 
 
317 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  37.66 
 
 
317 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  38.29 
 
 
317 aa  192  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  34.16 
 
 
461 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  34.78 
 
 
461 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  38.55 
 
 
316 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.31 
 
 
453 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  39.51 
 
 
461 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.97 
 
 
317 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.91 
 
 
442 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  37.81 
 
 
448 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  46.25 
 
 
321 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  35.2 
 
 
439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.64 
 
 
438 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  41.91 
 
 
451 aa  180  4e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  37.89 
 
 
327 aa  179  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  41.2 
 
 
324 aa  180  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  41.49 
 
 
469 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.41 
 
 
434 aa  178  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  40.25 
 
 
465 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  35.78 
 
 
456 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.06 
 
 
437 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  40.25 
 
 
465 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.31 
 
 
324 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  40.25 
 
 
502 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.96 
 
 
388 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.96 
 
 
358 aa  175  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  37.07 
 
 
469 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.64 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  38.7 
 
 
324 aa  172  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  39.42 
 
 
496 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.77 
 
 
375 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  38.87 
 
 
365 aa  169  8e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.4 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  36.86 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  36.86 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  35.58 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.8 
 
 
330 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.27 
 
 
339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.11 
 
 
314 aa  162  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  41.96 
 
 
446 aa  162  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.96 
 
 
314 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.91 
 
 
439 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  44.31 
 
 
444 aa  159  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  35.74 
 
 
327 aa  159  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.24 
 
 
443 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.620497 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>