183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0927 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0836  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0864  hypothetical protein  99.34 
 
 
302 aa  603  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0895  hypothetical protein  99.67 
 
 
302 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0950  hypothetical protein  99.34 
 
 
302 aa  603  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0927  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00747  predicted transferase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  91.39 
 
 
302 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2862  protein of unknown function UPF0052 and CofD  91.72 
 
 
302 aa  532  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000990783  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00764  hypothetical protein  91.39 
 
 
302 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.697988  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2863  protein of unknown function UPF0052 and CofD  91.72 
 
 
302 aa  532  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000381637  normal  0.0132805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0928  hypothetical protein  91.72 
 
 
302 aa  532  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0642233  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2572  hypothetical protein  91.72 
 
 
302 aa  532  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000058678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0803  hypothetical protein  91.72 
 
 
302 aa  531  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000436595  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0834  hypothetical protein  91.72 
 
 
302 aa  532  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0843  hypothetical protein  91.72 
 
 
302 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00101345  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1272  protein of unknown function UPF0052 and CofD  84.77 
 
 
302 aa  495  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303388  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2837  hypothetical protein  79.4 
 
 
307 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1432  hypothetical protein  79.4 
 
 
307 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2924  protein of unknown function UPF0052 and CofD  79.4 
 
 
307 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333236  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1511  hypothetical protein  78.81 
 
 
310 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1319  protein of unknown function UPF0052 and CofD  79.14 
 
 
305 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000691266  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2953  protein of unknown function UPF0052 and CofD  78.81 
 
 
302 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2533  protein of unknown function UPF0052 and CofD  75.17 
 
 
306 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2436  protein of unknown function UPF0052 and CofD  71.85 
 
 
311 aa  411  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156918  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0896  hypothetical protein  55.85 
 
 
314 aa  331  1e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002953  hypothetical protein  53.79 
 
 
298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.133639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02955  hypothetical protein  52.94 
 
 
301 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0542  hypothetical protein  53.56 
 
 
296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2207  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.99 
 
 
312 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00612561  normal  0.259269 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2227  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.62 
 
 
312 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000179515  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2157  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.62 
 
 
312 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0381242  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4500  hypothetical protein  53.62 
 
 
312 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2214  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.62 
 
 
312 aa  295  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00605686  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1956  hypothetical protein  57.81 
 
 
307 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2120  hypothetical protein  57.81 
 
 
307 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.385484  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2019  hypothetical protein  57.42 
 
 
307 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0865555  hitchhiker  0.0000000603841 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1960  hypothetical protein  50 
 
 
319 aa  292  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.592155  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2351  hypothetical protein  57.71 
 
 
306 aa  291  8e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1946  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.81 
 
 
307 aa  290  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2224  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.67 
 
 
299 aa  289  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1998  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.3 
 
 
303 aa  286  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413186  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2227  protein of unknown function UPF0052 and CofD  51.02 
 
 
303 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2412  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.32 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.11495  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2023  hypothetical protein  49.16 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.340724  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1804  hypothetical protein  52.07 
 
 
302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0263222  normal  0.492709 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1876  hypothetical protein  52.28 
 
 
292 aa  282  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.374483  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1891  hypothetical protein  51.4 
 
 
296 aa  282  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0737099  normal  0.0181662 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2836  hypothetical protein  46.39 
 
 
304 aa  266  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449877  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  43.19 
 
 
451 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.6 
 
 
453 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  43.66 
 
 
469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  40.62 
 
 
461 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.41 
 
 
463 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  40.18 
 
 
461 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.5 
 
 
458 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.5 
 
 
458 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  35.77 
 
 
458 aa  156  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  41.07 
 
 
496 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  41.31 
 
 
465 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  41.31 
 
 
502 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  41.31 
 
 
465 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  39.73 
 
 
461 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  36.25 
 
 
316 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.3 
 
 
442 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  39.29 
 
 
461 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  34.39 
 
 
327 aa  150  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.19 
 
 
443 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  35.25 
 
 
457 aa  149  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.47 
 
 
336 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  33.59 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  33.99 
 
 
331 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  33.99 
 
 
331 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.01 
 
 
336 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  32.98 
 
 
328 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20050  conserved hypothetical protein, cofD-related protein  34.71 
 
 
321 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17562  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2646  hypothetical protein  42.01 
 
 
336 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0000683151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  35.13 
 
 
317 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.33 
 
 
434 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.74 
 
 
330 aa  142  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.39 
 
 
438 aa  142  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.79 
 
 
428 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  32.2 
 
 
456 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  38.6 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.6 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.6 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.53 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  33.59 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15180  conserved hypothetical protein, cofD-related  35.91 
 
 
396 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.87 
 
 
310 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  33.67 
 
 
308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.55 
 
 
311 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  31.23 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  36.43 
 
 
446 aa  139  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.96 
 
 
314 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.09 
 
 
314 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.95 
 
 
324 aa  138  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.91 
 
 
339 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  36.51 
 
 
441 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1546  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35 
 
 
320 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.566126  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.48 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.61 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>