174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2023 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2023  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  653    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.340724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2224  protein of unknown function UPF0052 and CofD  66.56 
 
 		 299 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2227  protein of unknown function UPF0052 and CofD  67.47 
 
 		 312 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000179515  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2157  protein of unknown function UPF0052 and CofD  67.47 
 
 		 312 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0381242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2207  protein of unknown function UPF0052 and CofD  67.81 
 
 		 312 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00612561  normal  0.259269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2019  hypothetical protein  65.89 
 
 		 307 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0865555  hitchhiker  0.0000000603841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1956  hypothetical protein  66.22 
 
 		 307 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2120  hypothetical protein  66.22 
 
 		 307 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.385484  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4500  hypothetical protein  67.47 
 
 		 312 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2214  protein of unknown function UPF0052 and CofD  67.47 
 
 		 312 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00605686  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1946  protein of unknown function UPF0052 and CofD  65.56 
 
 		 307 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2351  hypothetical protein  65.44 
 
 		 306 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1960  hypothetical protein  64.07 
 
 		 319 aa  391  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.592155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1998  protein of unknown function UPF0052 and CofD  62.79 
 
 		 303 aa  387  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2412  protein of unknown function UPF0052 and CofD  61.54 
 
 		 300 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.11495  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1804  hypothetical protein  65.53 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0263222  normal  0.492709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2227  protein of unknown function UPF0052 and CofD  58.41 
 
 		 303 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0896  hypothetical protein  48.01 
 
 		 314 aa  293  4e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1876  hypothetical protein  52.08 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.374483  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0542  hypothetical protein  49.31 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02955  hypothetical protein  49.33 
 
 		 301 aa  268  8e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2836  hypothetical protein  46.71 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449877  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002953  hypothetical protein  49.48 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.133639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1891  hypothetical protein  47.75 
 
 		 296 aa  258  8e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0737099  normal  0.0181662 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2533  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.49 
 
 		 306 aa  256  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0895  hypothetical protein  49.16 
 
 		 302 aa  256  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2436  protein of unknown function UPF0052 and CofD  47.49 
 
 		 311 aa  255  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156918  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0836  hypothetical protein  49.16 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1272  protein of unknown function UPF0052 and CofD  47.37 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0927  hypothetical protein  49.16 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0864  hypothetical protein  49.16 
 
 		 302 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0950  hypothetical protein  49.16 
 
 		 302 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2953  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.67 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00747  predicted transferase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  55.08 
 
 		 302 aa  252  6e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00764  hypothetical protein  55.08 
 
 		 302 aa  252  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.697988  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2862  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.47 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000990783  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2572  hypothetical protein  55.47 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000058678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0834  hypothetical protein  55.47 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0843  hypothetical protein  55.47 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00101345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2863  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.47 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000381637  normal  0.0132805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0803  hypothetical protein  50.67 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000436595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0928  hypothetical protein  55.08 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0642233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1319  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.83 
 
 		 305 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000691266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2837  hypothetical protein  47.47 
 
 		 307 aa  248  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1432  hypothetical protein  47.47 
 
 		 307 aa  248  9e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2924  protein of unknown function UPF0052 and CofD  47.47 
 
 		 307 aa  248  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333236  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1511  hypothetical protein  48.84 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.55 
 
 		 330 aa  155  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  32.16 
 
 		 461 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  36.28 
 
 		 461 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.2 
 
 		 453 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  32.31 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  37 
 
 		 502 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  31.65 
 
 		 324 aa  143  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  33.07 
 
 		 458 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  36 
 
 		 469 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  35.56 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  36.28 
 
 		 461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  29.47 
 
 		 342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.33 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  34.29 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  34.29 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.81 
 
 		 463 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  35.84 
 
 		 496 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.51 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  30.29 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.06 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.29 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.29 
 
 		 340 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.06 
 
 		 310 aa  136  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  33.92 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.55 
 
 		 443 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  31.88 
 
 		 465 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  30.32 
 
 		 327 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  32.21 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  31.64 
 
 		 457 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.44 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  30.52 
 
 		 421 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.27 
 
 		 375 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  35.32 
 
 		 446 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  32.48 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.54 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.19 
 
 		 437 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15180  conserved hypothetical protein, cofD-related  37.05 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  32.57 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  29.24 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.57 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.68 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  36.07 
 
 		 341 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.54 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.74 
 
 		 458 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.74 
 
 		 458 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.53 
 
 		 428 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  30.87 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.79 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  31.35 
 
 		 441 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.6 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.49 
 
 		 434 aa  125  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  34.68 
 
 		 469 aa  125  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>