172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2412 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2412  protein of unknown function UPF0052 and CofD  100 
 
 		 300 aa  615  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.11495  hitchhiker  0.0000153595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2224  protein of unknown function UPF0052 and CofD  81.69 
 
 		 299 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2227  protein of unknown function UPF0052 and CofD  73.9 
 
 		 303 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1998  protein of unknown function UPF0052 and CofD  71.43 
 
 		 303 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1804  hypothetical protein  67.12 
 
 		 302 aa  418  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0263222  normal  0.492709 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4500  hypothetical protein  67.69 
 
 		 312 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2214  protein of unknown function UPF0052 and CofD  67.69 
 
 		 312 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00605686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2227  protein of unknown function UPF0052 and CofD  67.69 
 
 		 312 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000179515  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2157  protein of unknown function UPF0052 and CofD  67.69 
 
 		 312 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0381242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2207  protein of unknown function UPF0052 and CofD  67.35 
 
 		 312 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00612561  normal  0.259269 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2351  hypothetical protein  67.13 
 
 		 306 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1946  protein of unknown function UPF0052 and CofD  66.67 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2019  hypothetical protein  65.31 
 
 		 307 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0865555  hitchhiker  0.0000000603841 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1956  hypothetical protein  65.65 
 
 		 307 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2120  hypothetical protein  65.65 
 
 		 307 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.385484  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2023  hypothetical protein  61.54 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.340724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1960  hypothetical protein  57.09 
 
 		 319 aa  352  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.592155  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1876  hypothetical protein  52.43 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.374483  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0896  hypothetical protein  49.49 
 
 		 314 aa  295  5e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0542  hypothetical protein  51.94 
 
 		 296 aa  294  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002953  hypothetical protein  50.7 
 
 		 298 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.133639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02955  hypothetical protein  49.47 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1891  hypothetical protein  48.77 
 
 		 296 aa  278  9e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0737099  normal  0.0181662 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2436  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.83 
 
 		 311 aa  275  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156918  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2533  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2836  hypothetical protein  46.96 
 
 		 304 aa  269  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1272  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.67 
 
 		 302 aa  269  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0950  hypothetical protein  49.32 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0864  hypothetical protein  49.32 
 
 		 302 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0895  hypothetical protein  49.32 
 
 		 302 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00747  predicted transferase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  48.36 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0927  hypothetical protein  49.32 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0836  hypothetical protein  49.32 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00764  hypothetical protein  48.36 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.697988  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2953  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.64 
 
 		 302 aa  258  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1319  protein of unknown function UPF0052 and CofD  50.34 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000691266  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2862  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.68 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000990783  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0834  hypothetical protein  48.68 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0843  hypothetical protein  48.68 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00101345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2863  protein of unknown function UPF0052 and CofD  48.68 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000381637  normal  0.0132805 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2572  hypothetical protein  48.68 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000058678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1511  hypothetical protein  50 
 
 		 310 aa  255  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0928  hypothetical protein  48.36 
 
 		 302 aa  254  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0642233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0803  hypothetical protein  49.66 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000436595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2837  hypothetical protein  49.32 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1432  hypothetical protein  49.32 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2924  protein of unknown function UPF0052 and CofD  49.32 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333236  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  35.74 
 
 		 331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  35.74 
 
 		 331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.72 
 
 		 453 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  35.69 
 
 		 461 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.2 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  36.29 
 
 		 461 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.75 
 
 		 463 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  36.05 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  35.88 
 
 		 461 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  37.21 
 
 		 461 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2798  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.02 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000387933  decreased coverage  0.00000180817 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  32.31 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2397  hypothetical protein  37.55 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2444  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.55 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.400604  normal  0.128744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2438  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.55 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  32.4 
 
 		 458 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11451  hypothetical protein  38.49 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0675758 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.81 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  32 
 
 		 457 aa  149  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.14 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  34.23 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.91 
 
 		 442 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.72 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  32.43 
 
 		 456 aa  146  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.98 
 
 		 437 aa  146  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  32.68 
 
 		 421 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  37.6 
 
 		 443 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1254  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.91 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  32.45 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3713  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.53 
 
 		 339 aa  143  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.842124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  37.5 
 
 		 441 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2699  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.33 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.501391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.81 
 
 		 458 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  32.98 
 
 		 317 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.81 
 
 		 458 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1112  hypothetical protein  35.86 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  0.20804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.33 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  36.73 
 
 		 451 aa  140  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  30.61 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  33.2 
 
 		 502 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.59 
 
 		 318 aa  139  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  35.96 
 
 		 496 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15800  conserved hypothetical protein, cofD-related  37.96 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.41042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.6 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  33.73 
 
 		 465 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  36.28 
 
 		 469 aa  137  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  34.48 
 
 		 469 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  35.5 
 
 		 444 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20050  conserved hypothetical protein, cofD-related protein  37.84 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.17562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2528  protein of unknown function UPF0052 and CofD  35.25 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  33.73 
 
 		 465 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.32 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.73 
 
 		 457 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>