146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1672 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1672  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  832    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1986  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.27 
 
 		 401 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2698  hypothetical protein  37.5 
 
 		 396 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.22 
 
 		 394 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  hitchhiker  0.000000404226 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1907  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.54 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3600  hypothetical protein  37.78 
 
 		 391 aa  259  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2436  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.9 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2627  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.3 
 
 		 404 aa  252  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0878  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.73 
 
 		 473 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.13378 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1963  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.51 
 
 		 412 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6068  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.05 
 
 		 375 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4051  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.35 
 
 		 378 aa  113  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160133 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.75 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.81 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.43 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  28.22 
 
 		 461 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  25.82 
 
 		 439 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  25.13 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  28.57 
 
 		 461 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  27.53 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  27.87 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.13 
 
 		 314 aa  97.8  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  26.69 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.97 
 
 		 453 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  26.54 
 
 		 331 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  26.54 
 
 		 331 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.46 
 
 		 311 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.6 
 
 		 438 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  27.06 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  26.83 
 
 		 502 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.07 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  26.13 
 
 		 496 aa  90.5  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.84 
 
 		 437 aa  90.5  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  26.89 
 
 		 317 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.41 
 
 		 428 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  26.46 
 
 		 317 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  27.2 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  27.2 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  27.2 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  26.73 
 
 		 469 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  27.2 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  26.63 
 
 		 317 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  27.2 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  25.08 
 
 		 465 aa  87.8  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.46 
 
 		 317 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  26.19 
 
 		 317 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  25.08 
 
 		 465 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  25.76 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.06 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  25.09 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.61 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  24.76 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  26.09 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  27.39 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.45 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  25.77 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.76 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  25.48 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.08 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  25.23 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  25.77 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.26 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.26 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_2933  predicted protein  25.97 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.924332  normal  0.180994 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.4 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.12 
 
 		 310 aa  79.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  24.74 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  26.81 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.6 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.13 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  23.04 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.76 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.39 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.76 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.24 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  23.93 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  23.55 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  21.83 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_006686  CND03090  hypothetical protein  28.69 
 
 		 522 aa  69.7  0.00000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.700154  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  22.88 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  25.94 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  24.93 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0387  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.14 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000030565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.83 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00039  UPF0052 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12650)  24.23 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.757266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.83 
 
 		 336 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2646  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0000683151  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9153  hypothetical protein  25.37 
 
 		 212 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0896  hypothetical protein  24.75 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1272  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.04 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1403  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.21 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0067064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10630  conserved hypothetical protein, cofD-related  26.91 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.535112  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6040  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.22 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1995  hypothetical protein  25.34 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0864  hypothetical protein  24.45 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0895  hypothetical protein  24.45 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0927  hypothetical protein  24.45 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0950  hypothetical protein  23.75 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0836  hypothetical protein  24.45 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>