113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3600 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3600  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  796    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1986  protein of unknown function UPF0052 and CofD  53.67 
 
 		 401 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2698  hypothetical protein  52.67 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2436  protein of unknown function UPF0052 and CofD  46.7 
 
 		 396 aa  362  6e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.93 
 
 		 394 aa  338  9e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  hitchhiker  0.000000404226 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2627  protein of unknown function UPF0052 and CofD  45.4 
 
 		 404 aa  316  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1963  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.95 
 
 		 412 aa  275  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1907  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.41 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0878  protein of unknown function UPF0052 and CofD  38.75 
 
 		 473 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.13378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1672  hypothetical protein  37.78 
 
 		 405 aa  259  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4051  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.56 
 
 		 378 aa  142  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160133 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6068  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.86 
 
 		 375 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_2933  predicted protein  26.01 
 
 		 367 aa  112  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.924332  normal  0.180994 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.46 
 
 		 437 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  25.45 
 
 		 461 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.47 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.21 
 
 		 438 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  25.36 
 
 		 502 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  26.09 
 
 		 496 aa  88.2  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.79 
 
 		 323 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  23.87 
 
 		 331 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  23.87 
 
 		 331 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25 
 
 		 358 aa  86.3  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  27.76 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  27.76 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  28.03 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  27.76 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.52 
 
 		 375 aa  86.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  27.33 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  26.3 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.03 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.16 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  27.76 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  27.76 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  27.02 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  24.48 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  25.19 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  24.43 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  27.76 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  27.87 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  27.87 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  24.07 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  23.66 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  25.9 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.22 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.91 
 
 		 463 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  24.01 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  25.08 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.81 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.24 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.36 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  26.51 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  24.06 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  25.16 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  27.03 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.81 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  24.06 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.84 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  25.38 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  27.21 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25 
 
 		 324 aa  75.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9153  hypothetical protein  27.36 
 
 		 212 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.71 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  22.87 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  24.73 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.67 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.4 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.09 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.95 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.95 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.8 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2646  hypothetical protein  27.35 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0000683151  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.47 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.37 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  23.59 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.5 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.5 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00039  UPF0052 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12650)  28.64 
 
 		 535 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.757266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  24.59 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03090  hypothetical protein  25.24 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.700154  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  22.65 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  25.77 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.91 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.59 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0387  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.4 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000030565  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  23.69 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60952  conserved hypothetical protein  27.4 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.607875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.03 
 
 		 439 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  22.88 
 
 		 325 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  20.74 
 
 		 327 aa  53.5  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  22.3 
 
 		 324 aa  53.1  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1876  hypothetical protein  23.83 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.374483  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13090  conserved hypothetical protein, cofD-related  22.11 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.603465  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  19.78 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0896  hypothetical protein  23.05 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1254  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.69 
 
 		 317 aa  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2836  hypothetical protein  24.55 
 
 		 304 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  19.06 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2351  hypothetical protein  21.81 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1960  hypothetical protein  24.37 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.592155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>