108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0878 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0878  protein of unknown function UPF0052 and CofD  100 
 
 		 473 aa  923    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.13378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1907  protein of unknown function UPF0052 and CofD  55.08 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1963  protein of unknown function UPF0052 and CofD  44.44 
 
 		 412 aa  306  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1986  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42 
 
 		 401 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3600  hypothetical protein  38.9 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2627  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.04 
 
 		 404 aa  261  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2698  hypothetical protein  40.51 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1672  hypothetical protein  36.72 
 
 		 405 aa  254  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2436  protein of unknown function UPF0052 and CofD  39.34 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.36 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  hitchhiker  0.000000404226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4051  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.32 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160133 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6068  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.82 
 
 		 375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_2933  predicted protein  23.95 
 
 		 367 aa  94  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.924332  normal  0.180994 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9153  hypothetical protein  31.5 
 
 		 212 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.83 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00039  UPF0052 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12650)  24.63 
 
 		 535 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.757266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0387  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.08 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000030565  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.04 
 
 		 453 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  22.89 
 
 		 330 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  24 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  24 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  22.42 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  25.14 
 
 		 439 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.36 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.07 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.38 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.36 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.6 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  23.9 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  23.62 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  22.69 
 
 		 314 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03090  hypothetical protein  22.99 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.700154  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  23.72 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  22.19 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  28.84 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.17 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  23.43 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  31.12 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.88 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  23.91 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  28.04 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  24 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.46 
 
 		 375 aa  56.6  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  29.63 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  29.63 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  29.63 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  29.63 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  29.63 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  29.21 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.09 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  29.63 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  29.63 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  29.63 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.16 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60952  conserved hypothetical protein  22.83 
 
 		 488 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.607875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.63 
 
 		 317 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  29.63 
 
 		 317 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.76 
 
 		 314 aa  54.3  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  24.88 
 
 		 323 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  26.37 
 
 		 461 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  30.61 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  26.26 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  20.12 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25 
 
 		 317 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  32.05 
 
 		 458 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1403  protein of unknown function UPF0052 and CofD  36.15 
 
 		 338 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0067064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  30.38 
 
 		 461 aa  50.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  26.63 
 
 		 461 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  28.31 
 
 		 496 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  24.32 
 
 		 327 aa  50.4  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  43.55 
 
 		 463 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.78 
 
 		 458 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.78 
 
 		 458 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  32.38 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  23.55 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0997  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.37 
 
 		 350 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  28.64 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  47.06 
 
 		 316 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  28.64 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1272  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.25 
 
 		 302 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  21.99 
 
 		 325 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  41.67 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.7 
 
 		 318 aa  48.5  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2959  hypothetical protein  28.14 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.04 
 
 		 428 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2646  hypothetical protein  44.74 
 
 		 336 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0000683151  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  21.75 
 
 		 327 aa  48.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  40.74 
 
 		 336 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00747  predicted transferase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  42.11 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2862  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.11 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000990783  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  21.99 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0722  hypothetical protein  29.29 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.29229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0834  hypothetical protein  42.11 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0843  hypothetical protein  42.11 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00101345  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0210  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.7 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2863  protein of unknown function UPF0052 and CofD  42.11 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000381637  normal  0.0132805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0803  hypothetical protein  42.11 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000436595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2572  hypothetical protein  42.11 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000058678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0928  hypothetical protein  42.11 
 
 		 302 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0642233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00764  hypothetical protein  42.11 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.697988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>