184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4051 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4051  protein of unknown function UPF0052 and CofD  100 
 
 		 378 aa  765    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160133 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6068  protein of unknown function UPF0052 and CofD  52.34 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9153  hypothetical protein  44.02 
 
 		 212 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2698  hypothetical protein  33.12 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2627  protein of unknown function UPF0052 and CofD  33.33 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.800354 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3600  hypothetical protein  31.56 
 
 		 391 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1986  protein of unknown function UPF0052 and CofD  34.32 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2436  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.3 
 
 		 396 aa  139  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.06 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  hitchhiker  0.000000404226 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1907  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.03 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.434838 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1963  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.38 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3807  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.29 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.156704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0878  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.03 
 
 		 473 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.13378 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1672  hypothetical protein  27.35 
 
 		 405 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2640  protein of unknown function UPF0052 and CofD  32.44 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.235569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15870  conserved hypothetical protein, cofD-related TIGR01826  28.61 
 
 		 421 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000103935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4721  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.79 
 
 		 457 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0394  hypothetical protein  25.59 
 
 		 322 aa  109  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_2933  predicted protein  29.73 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.924332  normal  0.180994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2407  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.79 
 
 		 458 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2464  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.79 
 
 		 458 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0432493 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0417  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.16 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0155  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.53 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0667945  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2163  hypothetical protein  30.25 
 
 		 458 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2969  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.02 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000778436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3940  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.17 
 
 		 428 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000112442  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0114  hypothetical protein  28.01 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4456  hypothetical protein  29.71 
 
 		 457 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3053  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.57 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1179  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.54 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255866  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03241  hypothetical protein  28.32 
 
 		 461 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0321  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.2 
 
 		 438 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03141  hypothetical protein  28.86 
 
 		 461 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.782504  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0206  hypothetical protein  30.54 
 
 		 451 aa  98.6  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0613254  normal  0.498652 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1130  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.53 
 
 		 325 aa  98.6  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0233  hypothetical protein  30.54 
 
 		 469 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0263  hypothetical protein  29.48 
 
 		 316 aa  98.6  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0568  hypothetical protein  27.38 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.3622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2023  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.51 
 
 		 437 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1568  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25 
 
 		 358 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03151  hypothetical protein  28.86 
 
 		 461 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25231  hypothetical protein  30.54 
 
 		 496 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0116  hypothetical protein  30.35 
 
 		 456 aa  96.3  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.524575 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0791  hypothetical protein  28.43 
 
 		 331 aa  96.3  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.965349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0807  hypothetical protein  28.43 
 
 		 331 aa  96.3  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0434  hypothetical protein  29.41 
 
 		 328 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0293  hypothetical protein  28.19 
 
 		 461 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1657  hypothetical protein  31.88 
 
 		 465 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.878599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03711  hypothetical protein  31.88 
 
 		 465 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03171  hypothetical protein  30.2 
 
 		 502 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0259  hypothetical protein  30.79 
 
 		 446 aa  94  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0876  hypothetical protein  28.01 
 
 		 324 aa  92.8  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0386  hypothetical protein  28.72 
 
 		 469 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.915005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0677  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.37 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.049283  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2977  hypothetical protein  30.06 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602132  normal  0.033806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4947  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.08 
 
 		 317 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00423854  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5003  hypothetical protein  28.74 
 
 		 317 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4832  hypothetical protein  28.74 
 
 		 317 aa  90.5  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4847  hypothetical protein  28.74 
 
 		 317 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5383  hypothetical protein  28.74 
 
 		 317 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5239  hypothetical protein  28.74 
 
 		 317 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5258  hypothetical protein  28.74 
 
 		 317 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0886  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.34 
 
 		 375 aa  90.1  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5273  hypothetical protein  28.79 
 
 		 317 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.247204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5684  hypothetical protein  28.74 
 
 		 317 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5315  hypothetical protein  27.25 
 
 		 317 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0532  hypothetical protein  27.1 
 
 		 324 aa  89.7  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3697  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.04 
 
 		 317 aa  89.7  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280257  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07110  conserved hypothetical protein, cofD-related  28.25 
 
 		 375 aa  89.7  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3327  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.02 
 
 		 333 aa  89.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160109 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3146  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.06 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2007  hypothetical protein  29.84 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.632663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1125  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.49 
 
 		 314 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.311871  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1782  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.62 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1005  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.56 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307196  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1048  hypothetical protein  26.48 
 
 		 327 aa  87  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0387  protein of unknown function UPF0052 and CofD  28.44 
 
 		 328 aa  87  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000030565  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10630  conserved hypothetical protein, cofD-related  29.67 
 
 		 384 aa  86.3  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.535112  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0336  hypothetical protein  27.73 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1314  hypothetical protein  25.39 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0189864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1374  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.2 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.592756  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0328  protein of unknown function UPF0052 and CofD  27.69 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2613  protein of unknown function UPF0052 and CofD  30.84 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1158  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.26 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2188  hypothetical protein  25.67 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3100  protein of unknown function UPF0052 and CofD  31.13 
 
 		 331 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582963  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0594  protein of unknown function UPF0052 and CofD  23.82 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.837263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2289  protein of unknown function UPF0052 and CofD  25.33 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1403  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.6 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0067064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2827  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.77 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.336599  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00747  predicted transferase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  26.24 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.939553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00764  hypothetical protein  26.24 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.697988  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0803  hypothetical protein  26.6 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000436595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9154  hypothetical protein  50 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2732  protein of unknown function UPF0052 and CofD  29.77 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0512566  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0928  hypothetical protein  26.24 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0642233  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2862  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.24 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000990783  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2572  hypothetical protein  26.24 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000058678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2863  protein of unknown function UPF0052 and CofD  26.24 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000381637  normal  0.0132805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0834  hypothetical protein  26.24 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>