More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2353 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2353  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
415 aa  848    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0182  flagellar hook-associated protein FlgL  32.94 
 
 
424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0612  flagellar hook-associated protein 3  29.74 
 
 
417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.403095  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  30.26 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  30.26 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  25.58 
 
 
420 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  24.59 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  32.85 
 
 
297 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  25.57 
 
 
305 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  25.79 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  26.67 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  22.82 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  23.46 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  25.35 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  31.25 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  29.81 
 
 
594 aa  73.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  31.25 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  27.89 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  26.15 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  23.93 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  25.95 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1787  flagellar hook-associated protein 3  29.06 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  24.65 
 
 
401 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  22.7 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  23.34 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  23.72 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  26.79 
 
 
467 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  32 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  31.82 
 
 
297 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  26.94 
 
 
305 aa  67  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  27.74 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  29.93 
 
 
404 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  26.94 
 
 
532 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  28.97 
 
 
521 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  26.07 
 
 
468 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  28 
 
 
296 aa  64.7  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  31.54 
 
 
562 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  27.14 
 
 
309 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  30.83 
 
 
507 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  26.67 
 
 
400 aa  63.2  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  29.1 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  27.27 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  0.00000747775 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  25.84 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  24.62 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  23.11 
 
 
379 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1620  flagellar hook-associated protein 3  22.76 
 
 
497 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  27.64 
 
 
302 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  23.86 
 
 
462 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  23.57 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  28.08 
 
 
297 aa  60.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  27.4 
 
 
327 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  28.33 
 
 
523 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3961  flagellar hook-associated protein 3  25.26 
 
 
305 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  27.73 
 
 
301 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
287 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  26.04 
 
 
524 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  25.68 
 
 
305 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  21.41 
 
 
406 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  23.64 
 
 
609 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  23.45 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  22.07 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  22.96 
 
 
302 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  28.67 
 
 
501 aa  57.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  28.97 
 
 
494 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  26.53 
 
 
530 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  23.78 
 
 
317 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  22.22 
 
 
439 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  23.78 
 
 
317 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  28.49 
 
 
295 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  23.78 
 
 
317 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  23.78 
 
 
317 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  23.78 
 
 
317 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  26.34 
 
 
404 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  27.03 
 
 
326 aa  57  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  29.17 
 
 
497 aa  56.6  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  30.89 
 
 
492 aa  57  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1582  flagellin  28.33 
 
 
287 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000267264  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  23.78 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1706  flagellin  28.33 
 
 
287 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0636682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  24.39 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  21.78 
 
 
403 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3850  flagellin domain-containing protein  26.02 
 
 
502 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  24.39 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  25 
 
 
504 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  23.42 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  29.41 
 
 
273 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0623  flagellin domain protein  29.41 
 
 
290 aa  55.5  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  25.15 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  27.74 
 
 
523 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3024  flagellin domain protein  29.03 
 
 
339 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  23.61 
 
 
299 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  23.04 
 
 
384 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  27.73 
 
 
287 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  28.38 
 
 
305 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  27.86 
 
 
304 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  25.76 
 
 
412 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  27.73 
 
 
287 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  24.14 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  29.27 
 
 
492 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>