215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1787 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1787  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  30.85 
 
 
305 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  26.37 
 
 
297 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  25.69 
 
 
315 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  25.47 
 
 
309 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  25.39 
 
 
305 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  30.74 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  27.39 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  23.69 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  28.62 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  26.21 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  27.95 
 
 
341 aa  92.4  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  25.99 
 
 
313 aa  89.7  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  23.55 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  22.42 
 
 
297 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  35.88 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  24.77 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  25.38 
 
 
326 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  23.96 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  23.99 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  25.53 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  23.97 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  23.71 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  25.85 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  32.28 
 
 
594 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  33.86 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  22.29 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  28.57 
 
 
523 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2353  flagellar hook-associated protein FlgL  29.06 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0182  flagellar hook-associated protein FlgL  29.61 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  25.24 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  32.31 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  23.34 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  23.12 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  24.52 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  21.66 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  22.81 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  23.49 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  24.15 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  21.9 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  29.37 
 
 
400 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  27.22 
 
 
396 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  21.92 
 
 
316 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  33.08 
 
 
401 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  25.78 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  33.85 
 
 
403 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  27.78 
 
 
504 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  22.01 
 
 
298 aa  62.8  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  22.93 
 
 
287 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  22.93 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  28.46 
 
 
317 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  28.46 
 
 
317 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  28.46 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  28.46 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  29.23 
 
 
404 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  29.13 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  28.46 
 
 
317 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  29.71 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  28.46 
 
 
317 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  24.83 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  25.38 
 
 
507 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  28.46 
 
 
317 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  24.54 
 
 
319 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  27.31 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  28.46 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  25.4 
 
 
410 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  22.97 
 
 
287 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  22.93 
 
 
287 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  20.56 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  33.02 
 
 
404 aa  59.3  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  27.69 
 
 
870 aa  59.3  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 
412 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  24.91 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  27.56 
 
 
530 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  22.71 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  23.68 
 
 
304 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  29.92 
 
 
562 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  30.77 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4781  flagellar hook-associated protein 3  22.62 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.892762  normal  0.741415 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3704  flagellar hook-associated protein 3  22.62 
 
 
319 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218733  normal  0.125395 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  24.04 
 
 
299 aa  56.2  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  29.23 
 
 
317 aa  56.2  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0612  flagellar hook-associated protein 3  26.57 
 
 
417 aa  55.8  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.403095  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  25.38 
 
 
304 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  0.00000747775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  28.68 
 
 
401 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  28.68 
 
 
401 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  21.34 
 
 
287 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  24.74 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  21.15 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  25.47 
 
 
403 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  37.66 
 
 
1008 aa  55.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  26.79 
 
 
398 aa  54.7  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  21.43 
 
 
402 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  29.2 
 
 
420 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  21.66 
 
 
287 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>