213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1252 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  99.68 
 
 
317 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  99.68 
 
 
317 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
317 aa  648    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  99.68 
 
 
317 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  99.68 
 
 
317 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  82.65 
 
 
317 aa  541  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  82.33 
 
 
317 aa  541  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  82.02 
 
 
317 aa  537  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  82.33 
 
 
317 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  82.33 
 
 
317 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  82.65 
 
 
317 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  82.02 
 
 
317 aa  537  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  82.02 
 
 
317 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  71.29 
 
 
317 aa  456  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  60.31 
 
 
326 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  60.31 
 
 
326 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  60 
 
 
319 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  57.55 
 
 
317 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1878  flagellar hook-associated protein FlgL  53.12 
 
 
318 aa  332  5e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  46.42 
 
 
309 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  56.05 
 
 
248 aa  280  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  39.33 
 
 
312 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  37.25 
 
 
401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  36.08 
 
 
300 aa  202  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  35.74 
 
 
302 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  35.11 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  47.89 
 
 
412 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  34.06 
 
 
304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  46.52 
 
 
410 aa  162  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  31.94 
 
 
326 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  43.39 
 
 
404 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  40.86 
 
 
411 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  40.51 
 
 
411 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  40.51 
 
 
411 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  43.16 
 
 
403 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  39.78 
 
 
410 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  41.94 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  30.91 
 
 
316 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  41.18 
 
 
406 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  38.17 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3704  flagellar hook-associated protein 3  30 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218733  normal  0.125395 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  38.17 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4781  flagellar hook-associated protein 3  30 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.892762  normal  0.741415 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  38.17 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  38.17 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  38.17 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  38.17 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  38.17 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  37.44 
 
 
407 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  37.95 
 
 
407 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  41.33 
 
 
413 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  38.97 
 
 
413 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  38.97 
 
 
413 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  37.3 
 
 
439 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  34.21 
 
 
433 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  32.81 
 
 
404 aa  115  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  35.64 
 
 
562 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  34.16 
 
 
521 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  35.68 
 
 
416 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  36.02 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  30.16 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  36.02 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  28.16 
 
 
305 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  33.88 
 
 
410 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  33.85 
 
 
400 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  32.49 
 
 
420 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  30.85 
 
 
400 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  36.61 
 
 
396 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  26.67 
 
 
297 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  27.04 
 
 
299 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  32.26 
 
 
408 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  31.38 
 
 
411 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  28.67 
 
 
292 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  26.99 
 
 
298 aa  102  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  31.38 
 
 
411 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 
530 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  35.62 
 
 
400 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  26.81 
 
 
296 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  28.81 
 
 
297 aa  99.8  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  28.21 
 
 
341 aa  99  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  36.99 
 
 
401 aa  99  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  24.57 
 
 
400 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  33.51 
 
 
520 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  33.13 
 
 
396 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  36.84 
 
 
401 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  32.8 
 
 
532 aa  96.7  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  33.13 
 
 
396 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  33.56 
 
 
403 aa  95.9  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  33.56 
 
 
403 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  31.96 
 
 
400 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  33.77 
 
 
405 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  26.35 
 
 
305 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  26.3 
 
 
313 aa  94  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  27.14 
 
 
294 aa  93.2  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  34.25 
 
 
402 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  25.66 
 
 
304 aa  92  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  26.32 
 
 
304 aa  91.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  33.56 
 
 
403 aa  91.3  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  34.25 
 
 
402 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  25.86 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>