More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0193 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  100 
 
 
870 aa  1773    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  37.29 
 
 
296 aa  126  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  37.1 
 
 
302 aa  124  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  34.54 
 
 
328 aa  122  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  37.02 
 
 
301 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  36.61 
 
 
297 aa  121  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  38.19 
 
 
315 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  35 
 
 
297 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  33.51 
 
 
309 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  35.75 
 
 
327 aa  115  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  32.8 
 
 
305 aa  111  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  30.22 
 
 
301 aa  106  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  44.44 
 
 
301 aa  102  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  29.93 
 
 
1008 aa  94.4  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  32.16 
 
 
438 aa  91.7  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  36.96 
 
 
514 aa  90.5  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  26.79 
 
 
294 aa  89.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  29.51 
 
 
304 aa  87  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  29.51 
 
 
304 aa  87  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  29.73 
 
 
523 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1295  lagellar hook-associated protein FlgL  26.52 
 
 
740 aa  85.9  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  27.66 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  25.7 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  34.04 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0968  flagellin domain protein  24.31 
 
 
801 aa  81.3  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.743409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  28.18 
 
 
298 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  27.03 
 
 
298 aa  80.1  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  27.69 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  40.5 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0822  lagellar hook-associated protein FlgL  26.97 
 
 
744 aa  78.2  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  31.58 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  26.67 
 
 
306 aa  77  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  22.95 
 
 
296 aa  76.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  28.77 
 
 
594 aa  75.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  26.11 
 
 
306 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  29.41 
 
 
292 aa  73.9  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  28.12 
 
 
410 aa  73.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  26.92 
 
 
298 aa  73.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  26 
 
 
297 aa  72.8  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  26 
 
 
507 aa  72  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3036  flagellin domain protein  30.88 
 
 
799 aa  72  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
433 aa  72  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1620  flagellar hook-associated protein 3  29.05 
 
 
497 aa  71.2  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0894  lagellar hook-associated protein FlgL  25.14 
 
 
750 aa  70.5  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  28.42 
 
 
408 aa  70.5  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  25.31 
 
 
310 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0966  lagellar hook-associated protein FlgL  25.14 
 
 
750 aa  70.1  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  26.35 
 
 
504 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  29.45 
 
 
462 aa  69.3  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  25.39 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  24.59 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  26.81 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  26.22 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  26.78 
 
 
530 aa  67.8  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  27.17 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  26.22 
 
 
317 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  26.22 
 
 
317 aa  67  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  26.22 
 
 
317 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  25.27 
 
 
404 aa  67  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1031  lagellar hook-associated protein FlgL  24.58 
 
 
750 aa  67.4  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.143804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  29.71 
 
 
380 aa  67.4  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  26.22 
 
 
317 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  29.25 
 
 
532 aa  67.4  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  24.5 
 
 
404 aa  67.4  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  26.22 
 
 
317 aa  67  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  26.46 
 
 
420 aa  66.6  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  25.61 
 
 
317 aa  66.6  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0811  flagellin  30.07 
 
 
491 aa  67  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  28.19 
 
 
400 aa  66.6  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  31.65 
 
 
273 aa  66.6  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3850  flagellin domain-containing protein  27.53 
 
 
502 aa  66.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  27.2 
 
 
383 aa  67  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  26.22 
 
 
317 aa  67  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  25.34 
 
 
407 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  23.42 
 
 
295 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2000  flagellar hook-associated protein 3  30.92 
 
 
512 aa  65.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  35.19 
 
 
303 aa  65.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  25.34 
 
 
407 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  23.64 
 
 
402 aa  65.5  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1037  flagellar hook-associated protein FlgL  25.41 
 
 
701 aa  65.1  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.908763  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  28.77 
 
 
294 aa  65.1  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  24.73 
 
 
402 aa  64.7  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  27.72 
 
 
305 aa  64.7  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  28.57 
 
 
387 aa  64.3  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  31.3 
 
 
431 aa  64.3  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  25 
 
 
309 aa  64.3  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  25 
 
 
309 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  23.35 
 
 
411 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  24.84 
 
 
411 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  28.57 
 
 
389 aa  63.9  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  23.35 
 
 
411 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  31.76 
 
 
326 aa  63.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  24.86 
 
 
405 aa  63.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4189  flagellin domain protein  31.11 
 
 
385 aa  63.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3024  flagellin domain protein  28.08 
 
 
339 aa  63.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  24.38 
 
 
439 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  25.5 
 
 
377 aa  62.4  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  25.5 
 
 
377 aa  62.4  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  30.3 
 
 
384 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  30.3 
 
 
384 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>