293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1620 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1620  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
497 aa  982    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  38.9 
 
 
504 aa  324  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  37.7 
 
 
507 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  36 
 
 
523 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2000  flagellar hook-associated protein 3  35.73 
 
 
512 aa  273  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  37.2 
 
 
594 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  31.82 
 
 
297 aa  87  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  28.65 
 
 
301 aa  86.7  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  36.23 
 
 
327 aa  84  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  29.32 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  39.13 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  35.77 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  32.85 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  33.77 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  32.89 
 
 
396 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  35.06 
 
 
298 aa  79.7  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  34.46 
 
 
296 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  31.58 
 
 
297 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  31.61 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  33.92 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  27.41 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  32.12 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  32.41 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  35.37 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  31.61 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  27.93 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  36.11 
 
 
302 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  31.29 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  33.76 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  32.65 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  33.76 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  33.76 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  31.29 
 
 
295 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  33.76 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  36.23 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  31.13 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  36.23 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  36.23 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  32.65 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  29.05 
 
 
870 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  36.23 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  33.12 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  33.12 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  36.23 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  33.33 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2353  flagellar hook-associated protein FlgL  23.97 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
317 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  31.17 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  30.46 
 
 
401 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  32.65 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  33.33 
 
 
301 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  32.65 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  29.53 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  33.57 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  33.09 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  33.09 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  33.54 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  33.54 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  28.48 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  32.45 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  32.45 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  33.12 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  32.8 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  29.76 
 
 
299 aa  67  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  30.15 
 
 
410 aa  67  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  29.71 
 
 
298 aa  66.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  30.28 
 
 
401 aa  64.3  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  32.88 
 
 
521 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  26.17 
 
 
403 aa  64.3  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  26.17 
 
 
403 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  27.88 
 
 
416 aa  63.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  30.66 
 
 
297 aa  63.5  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  27.57 
 
 
1008 aa  63.5  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  31.85 
 
 
300 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  31.97 
 
 
523 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  30.36 
 
 
412 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  28.78 
 
 
402 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  33.12 
 
 
304 aa  61.6  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  31.08 
 
 
248 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  28.47 
 
 
295 aa  60.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  29.25 
 
 
298 aa  60.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  27.89 
 
 
410 aa  60.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  30.71 
 
 
433 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  27.34 
 
 
403 aa  60.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  31.08 
 
 
406 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  28.29 
 
 
408 aa  60.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  27.34 
 
 
403 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  32.67 
 
 
326 aa  60.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  27.34 
 
 
403 aa  60.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  31.08 
 
 
326 aa  60.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  31.08 
 
 
326 aa  60.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  28.06 
 
 
402 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  27.34 
 
 
403 aa  59.7  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  31.16 
 
 
562 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  32.61 
 
 
524 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  28.47 
 
 
298 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  32.89 
 
 
403 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  27.98 
 
 
302 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  30.87 
 
 
438 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>