294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3077 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  77.78 
 
 		 396 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 		 396 aa  800    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  76.52 
 
 		 396 aa  634    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  68.49 
 
 		 403 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  68.24 
 
 		 403 aa  564  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  68.49 
 
 		 403 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  68.24 
 
 		 403 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  68.49 
 
 		 403 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  66.58 
 
 		 401 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  67.74 
 
 		 403 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  67 
 
 		 403 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  61.35 
 
 		 400 aa  495  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  58.25 
 
 		 400 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  56.86 
 
 		 401 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  56.54 
 
 		 402 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  57.07 
 
 		 402 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  33.25 
 
 		 406 aa  219  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  31.52 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  31.75 
 
 		 411 aa  189  9e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  31.27 
 
 		 397 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  31.04 
 
 		 408 aa  180  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  30.69 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  29.53 
 
 		 397 aa  176  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  31.86 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  31.86 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  30.07 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  29.41 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  29.02 
 
 		 410 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  29.61 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  30.35 
 
 		 398 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  27.72 
 
 		 400 aa  159  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  32.04 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  27.94 
 
 		 420 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  28.89 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  28.64 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  30.98 
 
 		 401 aa  152  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  29.67 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  29.5 
 
 		 406 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  29.71 
 
 		 404 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  27.73 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  27.73 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  27.73 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  29.29 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  27.73 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  27.73 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  27.73 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  27.49 
 
 		 413 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  27.95 
 
 		 410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  28.09 
 
 		 405 aa  146  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  28.37 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  29.67 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  26.51 
 
 		 410 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  27.73 
 
 		 413 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  26.97 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  26.97 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  26.07 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  28.22 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  27.79 
 
 		 413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  26.34 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  26.84 
 
 		 407 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  28.16 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  38.65 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  25.37 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  36.07 
 
 		 562 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  26.12 
 
 		 420 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  36.02 
 
 		 521 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  29.73 
 
 		 302 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  31.23 
 
 		 530 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  26.48 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  32.99 
 
 		 311 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  33.33 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  26.81 
 
 		 428 aa  106  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  34.39 
 
 		 532 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 		 523 aa  103  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  30.66 
 
 		 530 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  29.15 
 
 		 524 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  25.63 
 
 		 326 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  25.95 
 
 		 326 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  25.95 
 
 		 326 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  32.07 
 
 		 305 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  33.13 
 
 		 317 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  33.13 
 
 		 317 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  33.13 
 
 		 317 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  33.13 
 
 		 317 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  33.13 
 
 		 317 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  34.24 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  30.05 
 
 		 305 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  34.41 
 
 		 521 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  34.24 
 
 		 317 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  33.15 
 
 		 297 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  31.64 
 
 		 299 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  33.7 
 
 		 319 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  33.7 
 
 		 317 aa  94  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  34.86 
 
 		 317 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  30.51 
 
 		 299 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  33.7 
 
 		 317 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  33.7 
 
 		 317 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  33.7 
 
 		 317 aa  93.2  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>