286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1331 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  89.08 
 
 
403 aa  740    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  87.84 
 
 
403 aa  729    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  88.83 
 
 
403 aa  736    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  88.59 
 
 
403 aa  733    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  95.29 
 
 
403 aa  773    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
403 aa  809    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  88.83 
 
 
403 aa  738    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  67.99 
 
 
401 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  67.49 
 
 
396 aa  578  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  68.49 
 
 
396 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  67 
 
 
396 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  62.53 
 
 
400 aa  519  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  61.29 
 
 
400 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  62.47 
 
 
402 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  62.22 
 
 
402 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  59.31 
 
 
401 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  33.01 
 
 
406 aa  219  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  33.51 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  30.53 
 
 
408 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  29.06 
 
 
411 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  31.02 
 
 
397 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  29.4 
 
 
411 aa  179  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  29.63 
 
 
400 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  29.56 
 
 
400 aa  178  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  28.89 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  29.95 
 
 
405 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  29.67 
 
 
420 aa  167  4e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  29.48 
 
 
400 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  27.41 
 
 
396 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  29.7 
 
 
398 aa  162  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  27.75 
 
 
410 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  28.3 
 
 
412 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  31.98 
 
 
410 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  28.99 
 
 
411 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  26.85 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  26.85 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  29.4 
 
 
401 aa  146  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  26.75 
 
 
404 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  29.76 
 
 
404 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  27.51 
 
 
417 aa  143  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  24.94 
 
 
399 aa  141  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  28.22 
 
 
439 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  28.85 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  26.65 
 
 
406 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  26.63 
 
 
410 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  26.63 
 
 
410 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  26.63 
 
 
410 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  26.63 
 
 
410 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  26.63 
 
 
410 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  26.63 
 
 
410 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  26.63 
 
 
410 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  28.44 
 
 
416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  28.5 
 
 
407 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  27.55 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  26.54 
 
 
411 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  25.71 
 
 
410 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  28.22 
 
 
410 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  26.46 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  25.71 
 
 
411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  25.71 
 
 
411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  26.44 
 
 
413 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  25.17 
 
 
433 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  24.94 
 
 
413 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  26.14 
 
 
413 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  26.51 
 
 
428 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  25.77 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  34.59 
 
 
300 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  24.41 
 
 
420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  35.79 
 
 
532 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  28.74 
 
 
523 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  30.88 
 
 
326 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
311 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  29.23 
 
 
302 aa  100  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
562 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  33.56 
 
 
317 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  33.56 
 
 
317 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  33.56 
 
 
317 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  33.56 
 
 
317 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  33.56 
 
 
317 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  33.16 
 
 
521 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  29.37 
 
 
530 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  34.17 
 
 
317 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  32.11 
 
 
530 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  32.26 
 
 
312 aa  93.2  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
317 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  33.33 
 
 
317 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  33.33 
 
 
317 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
317 aa  92  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
317 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
317 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
317 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
317 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  30.3 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  26.86 
 
 
521 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  31.28 
 
 
305 aa  89.4  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  31.72 
 
 
319 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  33.76 
 
 
297 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  37.41 
 
 
524 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 
305 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  31.35 
 
 
292 aa  86.7  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>