More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3724 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  100 
 
 		 410 aa  813    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  55.29 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  53.72 
 
 		 428 aa  411  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  53.33 
 
 		 420 aa  408  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  52.86 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  43.86 
 
 		 399 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  40.29 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  39.76 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  28.47 
 
 		 403 aa  143  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  28.71 
 
 		 403 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  28.22 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  28.16 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  27.49 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  28.33 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  27.49 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  29.12 
 
 		 404 aa  136  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  27.55 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  30.22 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  26.98 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  29.25 
 
 		 408 aa  130  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  27.19 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  28.17 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  28.17 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  28.91 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  27.51 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  27.92 
 
 		 396 aa  123  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  26.76 
 
 		 412 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  28.08 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  25.43 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  27 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  26.73 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  28.3 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  27.71 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  30.1 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  26.16 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  26.65 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  27.01 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  25.67 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  28.68 
 
 		 413 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  28.2 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  28.2 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  26.65 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  27.49 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  29.08 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  25.92 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  29.55 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  25.53 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  29.85 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  26.79 
 
 		 407 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  27.75 
 
 		 407 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  27.75 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  24.57 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  26.54 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  26.09 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  24.94 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  24.29 
 
 		 397 aa  99.8  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  23.9 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  24.64 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  24.64 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  24.64 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  24.64 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  24.64 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  24.64 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  24.64 
 
 		 410 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  23.06 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  30.02 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  23.26 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  24.59 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  34.87 
 
 		 317 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  34.87 
 
 		 317 aa  87  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  35.14 
 
 		 317 aa  87  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  35.14 
 
 		 317 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  35.14 
 
 		 317 aa  87  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  35.14 
 
 		 317 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  35.14 
 
 		 317 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  34.46 
 
 		 317 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  34.46 
 
 		 317 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  34.46 
 
 		 317 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  34.46 
 
 		 317 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  34.46 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  34.46 
 
 		 317 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  27.81 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  27.03 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  31.8 
 
 		 521 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  25.77 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1662  flagellin-like protein  25.49 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  32.97 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  30.82 
 
 		 521 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  25.75 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  25.75 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  37.1 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  33.1 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  26.11 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  31.03 
 
 		 300 aa  75.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  27.11 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  29.41 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  26.68 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  32.79 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  25.97 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  33.61 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>