234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2435 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
438 aa  890    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  34.46 
 
 
305 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  35.05 
 
 
297 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  23.83 
 
 
504 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0666  flagellin domain protein  34.34 
 
 
1008 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  36.81 
 
 
301 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  30.81 
 
 
301 aa  96.3  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  34 
 
 
297 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  34.39 
 
 
305 aa  94.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  31.72 
 
 
296 aa  94.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  32.16 
 
 
870 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  31.03 
 
 
298 aa  90.5  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  31.7 
 
 
305 aa  89.7  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  34.13 
 
 
305 aa  89  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  30.59 
 
 
309 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  29.78 
 
 
523 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  32.34 
 
 
303 aa  87.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  28.85 
 
 
305 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1787  flagellar hook-associated protein 3  35.88 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  24.59 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  26.33 
 
 
400 aa  84  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  33.88 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  34.03 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  31.69 
 
 
298 aa  82  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  31.93 
 
 
305 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0612  flagellar hook-associated protein 3  22.77 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.403095  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  32.86 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  32.86 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  23.99 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  31.55 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  28.97 
 
 
294 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  35.4 
 
 
400 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  29.05 
 
 
315 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  31.75 
 
 
507 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  29.88 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  31.82 
 
 
420 aa  77  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  22.92 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  34.19 
 
 
514 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  25.88 
 
 
407 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  31.25 
 
 
439 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  31.25 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  27.7 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  24.28 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  24.5 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  32.41 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  35 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  25.35 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  26.7 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  31.55 
 
 
302 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  30.43 
 
 
562 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  29.61 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  31.08 
 
 
594 aa  71.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  29.44 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  26.89 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  29.44 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  24.42 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  29.27 
 
 
298 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  23.13 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  30.94 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  32.33 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  30.82 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  28.66 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  30.82 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  28.93 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  27.6 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  27.6 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  27.6 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  27.6 
 
 
317 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  27.6 
 
 
317 aa  67  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  28.5 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  31.97 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  30.57 
 
 
396 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  31.97 
 
 
317 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  28.41 
 
 
401 aa  66.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  30.5 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  28.09 
 
 
317 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  28.09 
 
 
317 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  29.45 
 
 
300 aa  65.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  31.4 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  28.09 
 
 
317 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  28.09 
 
 
317 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  30.5 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  30.5 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  28.09 
 
 
317 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  29.81 
 
 
400 aa  65.1  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  28.18 
 
 
396 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2436  flagellar hook-associated protein FlgK  43.96 
 
 
586 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  30.06 
 
 
317 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  32 
 
 
295 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  31.36 
 
 
521 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  33.58 
 
 
413 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  26.46 
 
 
287 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  31.06 
 
 
521 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  31.33 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  29.19 
 
 
410 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  31.33 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  31.33 
 
 
248 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  27.81 
 
 
292 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  30.65 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>