207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2960 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
319 aa  646    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  63.08 
 
 
326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  63.08 
 
 
326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  58.36 
 
 
317 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  60 
 
 
317 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  60 
 
 
317 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  60 
 
 
317 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  60 
 
 
317 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  60 
 
 
317 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  58.13 
 
 
317 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  57.81 
 
 
317 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  58.44 
 
 
317 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  58.13 
 
 
317 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  57.81 
 
 
317 aa  368  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  58.13 
 
 
317 aa  368  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  58.13 
 
 
317 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  57.81 
 
 
317 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1878  flagellar hook-associated protein FlgL  55.17 
 
 
318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  51.25 
 
 
317 aa  317  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  62.5 
 
 
248 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  49.06 
 
 
309 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  40.8 
 
 
312 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  35.33 
 
 
300 aa  187  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  47.59 
 
 
401 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  32.5 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  45.45 
 
 
412 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  33.02 
 
 
304 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  44.86 
 
 
404 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  44.1 
 
 
410 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  32.5 
 
 
302 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4781  flagellar hook-associated protein 3  31.76 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.892762  normal  0.741415 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3704  flagellar hook-associated protein 3  31.76 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218733  normal  0.125395 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  31.35 
 
 
316 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  38.81 
 
 
406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  27.94 
 
 
411 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  44.62 
 
 
403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  38.46 
 
 
411 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  38.46 
 
 
411 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  38.46 
 
 
411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  38.5 
 
 
413 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  38.5 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  38.46 
 
 
410 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  37.95 
 
 
410 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  37.95 
 
 
410 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  37.95 
 
 
410 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  37.95 
 
 
410 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  37.95 
 
 
410 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  37.95 
 
 
410 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  37.95 
 
 
410 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  26.71 
 
 
326 aa  116  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  37.24 
 
 
413 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  36.7 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  34.41 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  34.59 
 
 
439 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  31.12 
 
 
305 aa  105  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  31.58 
 
 
408 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  32.24 
 
 
433 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  36.02 
 
 
404 aa  102  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  30.57 
 
 
400 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  33.7 
 
 
396 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  33.16 
 
 
562 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  34.78 
 
 
400 aa  99.4  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  33.51 
 
 
410 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  31.52 
 
 
401 aa  97.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  31.52 
 
 
401 aa  97.1  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  28.72 
 
 
400 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  32.61 
 
 
400 aa  96.7  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  34.02 
 
 
405 aa  96.3  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  31.38 
 
 
411 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  27.74 
 
 
296 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  33.7 
 
 
396 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  24.7 
 
 
313 aa  93.2  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  33.51 
 
 
401 aa  93.2  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  31.31 
 
 
420 aa  93.2  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  31.38 
 
 
411 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  29.7 
 
 
521 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  30.15 
 
 
416 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  31.91 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  26.56 
 
 
297 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  30.65 
 
 
408 aa  90.1  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  31.72 
 
 
403 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  27.08 
 
 
287 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  30.73 
 
 
530 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  31.18 
 
 
403 aa  86.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  32.26 
 
 
403 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  25.55 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  31.72 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  31.72 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  31.72 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  31.52 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  30.65 
 
 
524 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  32.26 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  24.76 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  25.95 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  29.9 
 
 
400 aa  83.2  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  30.98 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  27.85 
 
 
532 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  24.92 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3361  flagellar hook-associated protein 3  24.62 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  31.15 
 
 
520 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>