159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3704 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3704  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 		 319 aa  621  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218733  normal  0.125395 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4781  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 		 319 aa  621  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.892762  normal  0.741415 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0352  flagellar hook-associated protein 3  80.56 
 
 		 316 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0560824 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  32.7 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  32.39 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  31.76 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  31.27 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  34.16 
 
 		 309 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  30.31 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  26.49 
 
 		 404 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  30.19 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  30.31 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  30.31 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  31.5 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  31.5 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  30 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  29.56 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  29.56 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  29.56 
 
 		 317 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  30.31 
 
 		 317 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  29.69 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  27.54 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  28.97 
 
 		 304 aa  113  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  29.02 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1878  flagellar hook-associated protein FlgL  28.44 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  31.16 
 
 		 400 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  29.63 
 
 		 530 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  35.08 
 
 		 401 aa  92.4  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  33.69 
 
 		 410 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  30.69 
 
 		 530 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  31.91 
 
 		 400 aa  90.1  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  27.41 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  34.53 
 
 		 411 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  29.57 
 
 		 410 aa  86.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  31.75 
 
 		 524 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  32.09 
 
 		 410 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  32.09 
 
 		 410 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  32.09 
 
 		 410 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  32.09 
 
 		 410 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  32.09 
 
 		 410 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  32.09 
 
 		 410 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  34.22 
 
 		 413 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  33.51 
 
 		 401 aa  85.9  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  32.09 
 
 		 410 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  33.16 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  33.16 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  35.64 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  33.16 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  35.64 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1535  flagellar hook-associated protein 3  25.39 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  32.26 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  31.38 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  28.96 
 
 		 521 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  32.64 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  30.16 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  32.12 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  24.68 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  25.23 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  34.55 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  30.85 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  29.35 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  26.38 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  33.33 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  31.02 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0073  flagellar hook-associated protein 3 FlgL  25.58 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550392  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1709  flagellar hook-associated protein 3  25.58 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.718507  normal  0.0295245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  24.84 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  30.05 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  30.32 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  26.22 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  29.47 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  27.09 
 
 		 532 aa  77  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  31.55 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1662  flagellin-like protein  23.63 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.741191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  30.57 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  30.6 
 
 		 520 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  29.44 
 
 		 562 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  24.09 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  28.19 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  27.81 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  29.47 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  29.47 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  23.17 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  29.47 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  37.32 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  31.77 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  29.26 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  29.26 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  28.19 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  23.17 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  29.07 
 
 		 405 aa  72  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  31.05 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  23.93 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  30.89 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  26.6 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  26.6 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>