205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0623 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 
399 aa  800    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  44.71 
 
 
410 aa  297  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  43.37 
 
 
417 aa  296  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  42.52 
 
 
420 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  42.14 
 
 
420 aa  292  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  40.65 
 
 
428 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  38.96 
 
 
405 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  38.5 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  30.1 
 
 
411 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  28.47 
 
 
400 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  29.61 
 
 
411 aa  156  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  28.74 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  29.31 
 
 
412 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  24.51 
 
 
403 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  30.71 
 
 
401 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  24.88 
 
 
403 aa  142  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  27.87 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  24.94 
 
 
403 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  27.9 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  24.69 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  24.39 
 
 
403 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  24.63 
 
 
403 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  23.9 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  25.12 
 
 
400 aa  133  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  28.19 
 
 
401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  28.19 
 
 
401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  28.43 
 
 
400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  26.89 
 
 
404 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  24.69 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  25.37 
 
 
401 aa  126  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  27.05 
 
 
406 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  25.37 
 
 
396 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  27.21 
 
 
420 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  29.12 
 
 
416 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  28.17 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  25.31 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  26.78 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  23.02 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  25.06 
 
 
406 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  25.37 
 
 
402 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  24.08 
 
 
402 aa  116  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  26.28 
 
 
407 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  26.28 
 
 
407 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  25.06 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  25.74 
 
 
403 aa  109  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  28.44 
 
 
413 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  23.89 
 
 
396 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  24.88 
 
 
410 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  24.88 
 
 
410 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  24.88 
 
 
410 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  24.88 
 
 
410 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  24.88 
 
 
410 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  24.88 
 
 
410 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  22.5 
 
 
397 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  26.54 
 
 
404 aa  106  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  24.64 
 
 
410 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  26.87 
 
 
411 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  26.01 
 
 
408 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  26.24 
 
 
413 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  24.88 
 
 
410 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  27.57 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  27.57 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  27.4 
 
 
413 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  23.92 
 
 
433 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  25.45 
 
 
439 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  20.3 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  21.23 
 
 
397 aa  86.3  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  32.89 
 
 
319 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
317 aa  74.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2353  flagellar hook-associated protein FlgL  23.57 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  27.72 
 
 
524 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
521 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  29.53 
 
 
317 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  29.53 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  26.91 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  26.91 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  23.44 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  29.53 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  29.53 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  26.91 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  26.46 
 
 
317 aa  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  27.51 
 
 
530 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2009  flagellar hook-associated protein 3  28.75 
 
 
248 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  28.75 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  28.75 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  28.48 
 
 
317 aa  64.3  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  28.19 
 
 
300 aa  62.8  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  27.01 
 
 
305 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  25.52 
 
 
301 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  27.59 
 
 
299 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  23.49 
 
 
326 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  27.74 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  28.48 
 
 
521 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3568  flagellar hook-associated protein 3  27.39 
 
 
296 aa  60.5  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3941  flagellar hook-associated protein FlgL  26.09 
 
 
520 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186089  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  28.78 
 
 
302 aa  60.1  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>