More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0054 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0054  penicillin-binding protein, putative  100 
 
 		 1080 aa  2222    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  26.55 
 
 		 610 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  27.07 
 
 		 597 aa  99  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  23.88 
 
 		 627 aa  98.2  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  27.22 
 
 		 618 aa  96.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  25.26 
 
 		 633 aa  94.7  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1624  penicillin-binding protein 2  22.67 
 
 		 738 aa  94  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  25.28 
 
 		 638 aa  93.2  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  26.65 
 
 		 669 aa  90.1  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  25.21 
 
 		 618 aa  90.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  24.93 
 
 		 618 aa  89.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  24.93 
 
 		 618 aa  89.4  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  25.07 
 
 		 600 aa  89  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  25.48 
 
 		 703 aa  89  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  25.35 
 
 		 618 aa  88.6  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  25.35 
 
 		 618 aa  88.6  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  25.35 
 
 		 618 aa  88.6  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  25.21 
 
 		 618 aa  88.6  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  25.35 
 
 		 618 aa  88.6  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  25.61 
 
 		 618 aa  88.2  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  23.08 
 
 		 637 aa  87.8  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  22.84 
 
 		 638 aa  87.4  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  23.91 
 
 		 645 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  24.45 
 
 		 618 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  24.28 
 
 		 618 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  24.24 
 
 		 644 aa  86.3  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  30.77 
 
 		 663 aa  85.9  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  23.26 
 
 		 648 aa  85.1  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  23.6 
 
 		 610 aa  85.1  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  32.98 
 
 		 641 aa  84  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  22.08 
 
 		 625 aa  84  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  30.52 
 
 		 596 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  26.27 
 
 		 640 aa  84.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  21.85 
 
 		 615 aa  84.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  25.64 
 
 		 689 aa  84  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  21.54 
 
 		 612 aa  83.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4348  penicillin-binding protein 2  24.46 
 
 		 697 aa  83.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  25.68 
 
 		 661 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  25 
 
 		 678 aa  83.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  25 
 
 		 618 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  21.73 
 
 		 641 aa  82.4  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  25.62 
 
 		 686 aa  82  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  22.4 
 
 		 761 aa  82  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  30.83 
 
 		 646 aa  81.3  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  22.61 
 
 		 801 aa  80.9  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  23.91 
 
 		 679 aa  80.9  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  24.47 
 
 		 600 aa  80.5  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  27.27 
 
 		 709 aa  80.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  23.79 
 
 		 602 aa  80.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  22.67 
 
 		 775 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  23.51 
 
 		 634 aa  80.1  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  21.81 
 
 		 703 aa  79.7  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  22.4 
 
 		 760 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  22.4 
 
 		 765 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  22.4 
 
 		 765 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  21.99 
 
 		 634 aa  79.3  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  22.61 
 
 		 801 aa  79.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  23.85 
 
 		 755 aa  79  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4064  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.54 
 
 		 765 aa  79  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0742  penicillin-binding protein  32.05 
 
 		 599 aa  79  0.0000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.310072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  20.49 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  20.49 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  20.49 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  20.49 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  23.2 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  20.49 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  20.49 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  31.09 
 
 		 808 aa  78.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  22.4 
 
 		 756 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  20.49 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  22.39 
 
 		 643 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3462  peptidoglycan glycosyltransferase  24.01 
 
 		 708 aa  78.6  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  20.49 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  21.78 
 
 		 673 aa  78.2  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  22.4 
 
 		 764 aa  78.2  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  21.98 
 
 		 652 aa  77.8  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  23.51 
 
 		 632 aa  77.8  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  22.14 
 
 		 700 aa  78.2  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  20.49 
 
 		 633 aa  77.4  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  22.61 
 
 		 801 aa  77.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  30.74 
 
 		 657 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  22.16 
 
 		 655 aa  77.4  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  23.32 
 
 		 597 aa  77.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  22.69 
 
 		 610 aa  77.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  23.54 
 
 		 602 aa  77.4  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  21.11 
 
 		 633 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  21.85 
 
 		 645 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04259  penicillin-binding protein 2  23.71 
 
 		 686 aa  77.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209813  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  23.54 
 
 		 602 aa  77.4  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 643 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  22.93 
 
 		 809 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  22.93 
 
 		 802 aa  77  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  22.93 
 
 		 802 aa  77  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  22.93 
 
 		 802 aa  77  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  25.1 
 
 		 626 aa  76.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  22.93 
 
 		 803 aa  77  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  22.86 
 
 		 691 aa  77  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  24.15 
 
 		 630 aa  76.6  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  22.74 
 
 		 631 aa  76.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  23.03 
 
 		 609 aa  76.6  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>