More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30830 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30830  rRNA methylase  100 
 
 		 256 aa  493  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6302  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  68.02 
 
 		 248 aa  301  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1711  von Willebrand factor, type A  40.83 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.953337 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0343  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.46 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000467154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1084  RNA methyltransferase  34.02 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1036  RNA methyltransferase  34.02 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0003  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.94 
 
 		 250 aa  121  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2368  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.34 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  39.34 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2230  RNA methyltransferase  37.8 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0204347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2661  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.79 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1583  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.45 
 
 		 256 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.780301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.6 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1685  RNA methyltransferase  35.77 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1462  RNA methyltransferase  35.12 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0405731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1469  RNA methyltransferase  35.37 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1448  RNA methyltransferase  35.37 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0869  RNA methyltransferase  31.2 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1067  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.96 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1580  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  41.8 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1547  RNA methyltransferase  34.96 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.844862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2518  RNA methyltransferase  35.25 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00110794  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1523  RNA methyltransferase  34.96 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4689  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.55 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2929  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.38 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2172  RNA methyltransferase TrmH, group 3  38.91 
 
 		 237 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146478  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0147  RNA methyltransferase  35.19 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0728  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.06 
 
 		 244 aa  108  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0988  tRNA/rRNA methyltransferase  30.8 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0209  RNA methyltransferase  27.73 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1262  RNA methyltransferase  34.84 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0146  RNA methyltransferase  34.84 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1799  RNA methyltransferase  34.84 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.335408  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1746  RNA methyltransferase  34.84 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1817  RNA methyltransferase  34.84 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.135393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1020  RNA methyltransferase  34.84 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0199854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0267  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.44 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000223613  normal  0.011395 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2352  putative tRNA/rRNA methyltransferase YacO  32.1 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.177652  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1295  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.06 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1971  RNA methyltransferase  34.84 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1425  rRNA methylase  29.39 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0848  RNA methyltransferase  31.69 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000264025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2889  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.2 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0313  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.2 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000179001  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0122  tRNA/rRNA methyltransferase  29.46 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1677  RNA methyltransferase  34.71 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2065  rRNA methylase  28.22 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00990  RNA methyltransferase  30.08 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1336  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.33 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000822091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3322  RNA methyltransferase  31.71 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.752431  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3418  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  34.07 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125093  normal  0.287966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1165  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.16 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0092  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.86 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1867  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.58 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0753  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  37.02 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205206  hitchhiker  0.000134961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1696  RNA methyltransferase  34.55 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1229  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  33.33 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00902362  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0092  hypothetical protein  31.82 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0554  RNA methyltransferase  29.22 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.850775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0405  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  36.4 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0083776  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0174  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  28.63 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000034032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1909  RNA methyltransferase  32.8 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000520024  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1708  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.15 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0196  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000588208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0264  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.28 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0568  RNA methyltransferase  29.22 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.927994  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0265  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  31.28 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2481  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.66 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314444  hitchhiker  0.00338936 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0083  RNA methyltransferase  35.63 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1848  RNA methyltransferase  33.87 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0107  hypothetical protein  31.82 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1073  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  34.16 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.5513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.39 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0590  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.5 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629521 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2539  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.15 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0797344  normal  0.558378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4216  23S rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase  36.54 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3320  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  32.11 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000334493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0086  RNA methyltransferase  30.89 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1822  rRNA methylase  30.2 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0172  RNA methyltransferase  28.98 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0806813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2060  RNA methyltransferase  31.15 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4146  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.33 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0305  RNA methyltransferase  29.11 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1222  RNA methyltransferase  25.3 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0117794  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1003  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.51 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60779  normal  0.0289199 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0906  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  33.74 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2796  RNA methyltransferase  33.61 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125421  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0596  RNA methyltransferase  26.78 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1517  RNA methyltransferase  30.04 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.826104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5214  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.49 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000196945  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0306  TrmH family tRNA methyltransferase  29.1 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0091  RNA methyltransferase  30.08 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00797863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0091  RNA methyltransferase  30.08 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0088  tRNA/rRNA methyltransferase SpoU  30.08 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000158072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0087  TrmH family tRNA methyltransferase  30.08 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0091  RNA methyltransferase  30.08 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000227809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0122  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.08 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000258465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0102  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.08 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.238e-61 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4221  RNA methyltransferase  37.45 
 
 		 373 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0112  RNA methyltransferase, TrmH family, group 3  30.08 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0011476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>