More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18380 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18380  acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 549 aa  1100    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1798  Acyl-CoA dehydrogenases  42.24 
 
 		 597 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1712  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.06 
 
 		 597 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.312835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0275  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.24 
 
 		 1189 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0295  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.87 
 
 		 597 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483895  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1018  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.87 
 
 		 597 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0256489  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1300  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.87 
 
 		 597 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1648  Acyl-CoA dehydrogenase  28.38 
 
 		 602 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.458371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0028  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.79 
 
 		 603 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.79 
 
 		 603 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0227659  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2151  hypothetical protein  27.85 
 
 		 563 aa  198  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2177  hypothetical protein  27.04 
 
 		 563 aa  192  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0276  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  32.28 
 
 		 586 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1017  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.29 
 
 		 586 aa  187  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0431122  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0294  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.29 
 
 		 586 aa  187  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0434167  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1301  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.29 
 
 		 586 aa  187  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1799  Acyl-CoA dehydrogenases  32.28 
 
 		 586 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1713  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.29 
 
 		 586 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5628  Acyl-CoA dehydrogenase  29.05 
 
 		 603 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.491683  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18370  acyl-CoA dehydrogenase  30.71 
 
 		 583 aa  177  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5627  Acyl-CoA dehydrogenase  30.62 
 
 		 548 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.124757  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1224  acyl-CoA dehydrogenase-like  26.38 
 
 		 394 aa  107  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0161366  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1375  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.99 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0198  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.88 
 
 		 387 aa  103  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140883  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1165  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.29 
 
 		 389 aa  101  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.06 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1788  hypothetical protein  25.46 
 
 		 389 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1603  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.15 
 
 		 389 aa  99.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1787  hypothetical protein  25.46 
 
 		 389 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1168  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.11 
 
 		 385 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0037  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.38 
 
 		 387 aa  98.6  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.119681  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1529  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  27.36 
 
 		 389 aa  98.2  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2506  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.53 
 
 		 385 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2570  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.69 
 
 		 389 aa  97.4  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4367  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.74 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0732  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.37 
 
 		 387 aa  96.3  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1371  butyryl-CoA dehydrogenase  27.91 
 
 		 389 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.183303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3313  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.66 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  25.6 
 
 		 379 aa  95.9  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.82 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1549  butyryl-CoA dehydrogenase  28.94 
 
 		 387 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.431805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3223  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.38 
 
 		 389 aa  95.1  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1739  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.6 
 
 		 390 aa  95.1  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4272  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.54 
 
 		 390 aa  94.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0196507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1948  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.66 
 
 		 387 aa  94.7  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113187  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2780  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.38 
 
 		 390 aa  94.7  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3933  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.85 
 
 		 390 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2033  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.15 
 
 		 387 aa  94  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0666462  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  22.52 
 
 		 381 aa  94  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0148  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  26.5 
 
 		 385 aa  93.6  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0130  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.5 
 
 		 385 aa  93.6  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5062  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  25.43 
 
 		 387 aa  93.6  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0931  isovaleryl-CoA dehydrogenase  26.71 
 
 		 386 aa  93.6  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.46 
 
 		 390 aa  93.2  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1645  isovaleryl-CoA dehydrogenase  27.95 
 
 		 387 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2121  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.85 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.274166  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49560  Acyl-CoA dehydrogenase  25.45 
 
 		 393 aa  92.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.531636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1804  butyryl-CoA dehydrogenase  27.71 
 
 		 386 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03805  acyl-CoA dehydrogenase  27.27 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1436  butyryl-CoA dehydrogenase  25.35 
 
 		 410 aa  92.8  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.170652  hitchhiker  0.00553945 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0788  butyryl-CoA dehydrogenase  28.69 
 
 		 380 aa  92.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0017  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.15 
 
 		 382 aa  91.3  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0167  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.44 
 
 		 376 aa  91.3  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2322  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.06 
 
 		 389 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2394  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.07 
 
 		 389 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.869835 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1672  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.06 
 
 		 389 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1260  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.94 
 
 		 394 aa  91.3  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.334789  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04688  Isovaleryl-coenzyme A dehydrogenase (EC 1.3.99.10) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L6]  26.24 
 
 		 431 aa  90.9  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0020  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.15 
 
 		 382 aa  90.9  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2119  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.05 
 
 		 390 aa  90.5  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148025 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2925  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.92 
 
 		 389 aa  90.9  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2846  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.75 
 
 		 389 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0220  acyl-CoA dehydrogenase  25.4 
 
 		 384 aa  90.5  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0793985  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1647  acyl-CoA dehydrogenase  27.74 
 
 		 385 aa  90.1  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.658516  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3387  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.61 
 
 		 391 aa  90.5  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1918  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.92 
 
 		 379 aa  90.1  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1362  isovaleryl-CoA dehydrogenase  24.31 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.09 
 
 		 376 aa  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3002  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.02 
 
 		 388 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2278  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.93 
 
 		 390 aa  89.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.59 
 
 		 379 aa  89.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3633  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  25.6 
 
 		 386 aa  89.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0817586  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0226  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.16 
 
 		 388 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.597403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1458  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.77 
 
 		 389 aa  89.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.499178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.45 
 
 		 379 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3018  Acyl-CoA dehydrogenase  23.68 
 
 		 407 aa  89.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  24.36 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0876  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.52 
 
 		 387 aa  89.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.189497  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3693  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.23 
 
 		 390 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1191  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.32 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0488  butyryl-CoA dehydrogenase  25.63 
 
 		 379 aa  89  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00678793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  23.77 
 
 		 389 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.69 
 
 		 381 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1874  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.13 
 
 		 387 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.33835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  24.93 
 
 		 379 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1897  isovaleryl-CoA dehydrogenase  23.75 
 
 		 389 aa  88.2  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  24.64 
 
 		 379 aa  87.8  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1142  isovaleryl-CoA dehydrogenase  25.17 
 
 		 386 aa  87.8  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268805  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2087  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  26.87 
 
 		 378 aa  87.8  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1503  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.2 
 
 		 379 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.96739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>