More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1161 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1161  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 261 aa  511  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  79.52 
 
 		 535 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  82.21 
 
 		 540 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  40.49 
 
 		 511 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  38.79 
 
 		 511 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  39.02 
 
 		 518 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  36.02 
 
 		 544 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  41.82 
 
 		 481 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  35.85 
 
 		 461 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10582  FAD binding monooxygenase, putative (JCVI)  36.65 
 
 		 566 aa  99  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.832072  normal  0.150999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  39.51 
 
 		 493 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  38.12 
 
 		 968 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  37.74 
 
 		 486 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  39.38 
 
 		 547 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  38.51 
 
 		 552 aa  95.9  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  38.61 
 
 		 388 aa  95.5  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4320  monooxygenase FAD-binding  38.22 
 
 		 522 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  38.12 
 
 		 486 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5698  monooxygenase FAD-binding  33.13 
 
 		 531 aa  92.8  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0767168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  33.94 
 
 		 529 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  37.27 
 
 		 497 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3281  pentachlorophenol-4-monooxygenase  35.5 
 
 		 414 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  36.08 
 
 		 548 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  34.81 
 
 		 574 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  36.08 
 
 		 548 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  36.08 
 
 		 548 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  33.13 
 
 		 553 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  34.18 
 
 		 574 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  34.81 
 
 		 571 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  35.15 
 
 		 512 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  37.97 
 
 		 546 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  32.99 
 
 		 488 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  36.71 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  34.57 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  35.44 
 
 		 479 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  33.18 
 
 		 499 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  33.54 
 
 		 477 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  36.08 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  35.44 
 
 		 550 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  36.65 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  35.44 
 
 		 550 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  36.08 
 
 		 548 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  33.54 
 
 		 501 aa  78.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  36.99 
 
 		 546 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  33.75 
 
 		 486 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  35.44 
 
 		 548 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  35.44 
 
 		 611 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  35.44 
 
 		 548 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  34.76 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  35.37 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.44 
 
 		 548 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  35.37 
 
 		 502 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  32.91 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.44 
 
 		 548 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0290  monooxygenase FAD-binding  35.4 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  34.81 
 
 		 538 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  33.54 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  34.81 
 
 		 538 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5297  monooxygenase, FAD-binding protein  34.94 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.85745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5676  monooxygenase, FAD-binding  34.94 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5386  monooxygenase, FAD-binding  34.94 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  35.37 
 
 		 502 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  33.12 
 
 		 492 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04530  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  37.5 
 
 		 457 aa  75.5  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.722855  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  33.33 
 
 		 537 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  33.33 
 
 		 537 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  33.33 
 
 		 537 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  35.75 
 
 		 562 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4799  monooxygenase FAD-binding  39.29 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  35.15 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  36.05 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  34.15 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  37.97 
 
 		 477 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2454  regulatory proteins, IclR  33.92 
 
 		 575 aa  73.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.283629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3485  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductases-like  32.91 
 
 		 557 aa  73.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1733  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-related FAD-dependent oxidoreductase  38.61 
 
 		 490 aa  72.8  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  34.15 
 
 		 471 aa  72.4  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  35.15 
 
 		 508 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  33.74 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  38.85 
 
 		 485 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3235  phenol 2-monooxygenase  34.86 
 
 		 634 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1323  FAD-dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 545 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  32.28 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0850  FAD-dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 555 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0192309  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  36.94 
 
 		 486 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3055  monooxygenase FAD-binding  28.92 
 
 		 408 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11187  conserved hypothetical protein  27.59 
 
 		 629 aa  68.9  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 535 aa  68.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  33.12 
 
 		 479 aa  68.6  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  32.53 
 
 		 504 aa  68.6  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6383  phenol 2-monooxygenase  30.2 
 
 		 631 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  normal  0.925531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0822  phenol 2-monooxygenase  34.86 
 
 		 634 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0579  FAD-dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5651  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 		 547 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  30.82 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6872  phenol 2-monooxygenase  31.43 
 
 		 634 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  30.82 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  30.22 
 
 		 559 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  32.1 
 
 		 489 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  33.71 
 
 		 556 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>