45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1533 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1533  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 93 aa  180  8.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1558  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0137  hypothetical protein  42.05 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00282501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1566  conserved hypothetical protein  35.23 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  36.84 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1541  putative transcriptional regulator  37.35 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  28.26 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  22.97 
 
 		 183 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  30.3 
 
 		 143 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 155 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  24.05 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 158 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  33.73 
 
 		 142 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>