18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1541 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1541  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 86 aa  166  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1544  conserved hypothetical protein  37.8 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1533  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1558  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0137  hypothetical protein  40.96 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00282501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  30.3 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 352 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 334 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>