More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4275 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4275  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 263 aa  521  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000930353  normal  0.309255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0330  acetylglutamate kinase  83.08 
 
 		 261 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0228  acetylglutamate kinase  79.69 
 
 		 267 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.636422  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3708  acetylglutamate kinase  79.62 
 
 		 260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0203  acetylglutamate kinase  76.15 
 
 		 261 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.515278  normal  0.0763736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0237  acetylglutamate kinase  79.23 
 
 		 260 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3904  acetylglutamate kinase  78.85 
 
 		 260 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.285866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0276  acetylglutamate kinase  78.46 
 
 		 260 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4123  acetylglutamate kinase  77.31 
 
 		 260 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4094  acetylglutamate kinase  77.31 
 
 		 260 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4212  acetylglutamate kinase  77.31 
 
 		 260 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4013  acetylglutamate kinase  77.31 
 
 		 260 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.673186 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3716  acetylglutamate kinase  77.31 
 
 		 260 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.948658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0251  acetylglutamate kinase  75 
 
 		 260 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0192  acetylglutamate kinase  77.04 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0257  acetylglutamate kinase  72.69 
 
 		 262 aa  358  4e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00042  acetylglutamate kinase  50.78 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002313  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 263 aa  245  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824681  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2219  acetylglutamate kinase  49.61 
 
 		 262 aa  246  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.448521  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4250  acetylglutamate kinase  48.43 
 
 		 257 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.531386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4059  acetylglutamate kinase  48.03 
 
 		 257 aa  228  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4363  acetylglutamate kinase  48.82 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4453  acetylglutamate kinase  48.82 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4450  acetylglutamate kinase  48.82 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178281 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4527  acetylglutamate kinase  48.82 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020893 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4332  acetylglutamate kinase  48.82 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3918  acetylglutamate kinase  46.46 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4780  acetylglutamate kinase  48.82 
 
 		 257 aa  224  9e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3897  acetylglutamate kinase  48.03 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4088  acetylglutamate kinase  48.03 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0128  acetylglutamate kinase  48.03 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4027  acetylglutamate kinase  48.03 
 
 		 257 aa  221  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03844  acetylglutamate kinase  48.03 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4027  acetylglutamate kinase  48.03 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5419  acetylglutamate kinase  48.03 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4498  acetylglutamate kinase  48.03 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.890825  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4057  acetylglutamate kinase  48.03 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.650697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4406  acetylglutamate kinase  48.03 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0773031 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0196  acetylglutamate kinase  46.06 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4445  acetylglutamate kinase  48.03 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03793  hypothetical protein  48.03 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4193  acetylglutamate kinase  48.03 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2757  acetylglutamate kinase  47.53 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0981  acetylglutamate kinase  49.22 
 
 		 257 aa  214  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.71344  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0229  acetylglutamate kinase  44.84 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0059376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00531  acetylglutamate kinase  47.69 
 
 		 267 aa  199  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0461  acetylglutamate kinase  44.09 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  36.4 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  34.38 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  31.68 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  29.41 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  34.24 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  32.83 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  33.46 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  33.46 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  35.9 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  33.85 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  33.85 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0854  acetylglutamate kinase  30.5 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.277534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  33.76 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  32.33 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  35.44 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52011  predicted protein  35.14 
 
 		 334 aa  107  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367344  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  33.33 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04991  acetylglutamate kinase  33.03 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  30.94 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2653  acetylglutamate kinase  30.6 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.485023 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  31.99 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  28.83 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4240  acetylglutamate kinase  30.56 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  30.45 
 
 		 305 aa  105  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  31.25 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0738  acetylglutamate kinase  31.37 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0640766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  34.45 
 
 		 336 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0056  acetylglutamate kinase  30.43 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1641  acetylglutamate kinase  30.37 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0301  acetylglutamate kinase  32.43 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.84379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0859  acetylglutamate kinase  32.22 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1854  acetylglutamate kinase  34.6 
 
 		 296 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  29.78 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1131  acetylglutamate kinase  32.91 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1381  acetylglutamate kinase  29.57 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0028  acetylglutamate kinase  32.44 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1162  acetylglutamate kinase  32.91 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.174929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4154  acetylglutamate kinase  31.35 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  31.2 
 
 		 296 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  29.2 
 
 		 300 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  31.46 
 
 		 291 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0071  acetylglutamate kinase  31.84 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.945463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  31.09 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3963  acetylglutamate kinase  30.56 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00282124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  34.75 
 
 		 313 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0154  acetylglutamate kinase  30.6 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0539  acetylglutamate kinase  30.83 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  34.87 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1090  acetylglutamate kinase  30.51 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.171552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2910  acetylglutamate kinase  34.75 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  31.75 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  30.4 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4264  acetylglutamate kinase  30.95 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>