More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0190 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0190  acetylglutamate kinase  100 
 
 
260 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  47.78 
 
 
295 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  47.04 
 
 
295 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  48.09 
 
 
294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  48.85 
 
 
305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  47.71 
 
 
287 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  45.39 
 
 
295 aa  232  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  45.11 
 
 
294 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  45.19 
 
 
295 aa  231  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52011  predicted protein  51.75 
 
 
334 aa  231  9e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.367344  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2621  acetylglutamate kinase  48.15 
 
 
298 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2342  acetylglutamate kinase  48.15 
 
 
298 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791434  normal  0.660777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  44.57 
 
 
300 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  48.51 
 
 
313 aa  227  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  46.49 
 
 
312 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  45.56 
 
 
301 aa  227  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0954  acetylglutamate kinase  46.67 
 
 
297 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.576098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1384  acetylglutamate kinase  46.3 
 
 
304 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  44.78 
 
 
292 aa  225  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  47.47 
 
 
290 aa  224  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  47.47 
 
 
290 aa  224  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2297  acetylglutamate kinase  47.04 
 
 
298 aa  224  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  46.12 
 
 
303 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0868  acetylglutamate kinase  46.3 
 
 
304 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  45.8 
 
 
287 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0814  acetylglutamate kinase  45.56 
 
 
298 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  46.84 
 
 
298 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0633  acetylglutamate kinase  45.93 
 
 
298 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  43.98 
 
 
293 aa  221  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  43.91 
 
 
296 aa  221  8e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  43.07 
 
 
301 aa  221  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  42.7 
 
 
301 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  44.4 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  42.7 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  44.94 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  43.8 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  42.7 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  42.7 
 
 
301 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  42.91 
 
 
295 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7329  acetylglutamate kinase  44.81 
 
 
298 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  41.95 
 
 
301 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0680  acetylglutamate kinase  45.56 
 
 
298 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  42.54 
 
 
306 aa  219  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  43.66 
 
 
293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  44.94 
 
 
292 aa  218  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1358  acetylglutamate kinase  47.04 
 
 
296 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3700  acetylglutamate kinase  45.56 
 
 
298 aa  219  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  46.15 
 
 
301 aa  218  6e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1025  acetylglutamate kinase  46.86 
 
 
296 aa  218  7e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0966  acetylglutamate kinase  46.86 
 
 
296 aa  218  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  48.88 
 
 
336 aa  218  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3095  acetylglutamate kinase  50.56 
 
 
302 aa  218  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  42.54 
 
 
305 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  43.75 
 
 
292 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  42.32 
 
 
301 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  42.32 
 
 
301 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0072  acetylglutamate kinase  45.56 
 
 
298 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00499393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  46.48 
 
 
293 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3071  acetylglutamate kinase  44.81 
 
 
298 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  41.64 
 
 
301 aa  217  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  46.48 
 
 
293 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  46.48 
 
 
292 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  45.56 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  41.95 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  41.95 
 
 
301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0013  acetylglutamate kinase  46.24 
 
 
302 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  43.45 
 
 
300 aa  215  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  41.42 
 
 
309 aa  214  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  43.08 
 
 
299 aa  214  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  43.28 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4385  acetylglutamate kinase  42.32 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614022  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  42.16 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0338  acetylglutamate kinase  42.32 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  42.16 
 
 
301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0033  acetylglutamate kinase  41.42 
 
 
310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  41.57 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  44.44 
 
 
305 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  46.9 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0064  acetylglutamate kinase  42.32 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207968  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  42.32 
 
 
300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  41.95 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  43.19 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  42.54 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  42.91 
 
 
292 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  43.49 
 
 
296 aa  212  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0324  acetylglutamate kinase  46.69 
 
 
287 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.491958 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  41.42 
 
 
344 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  40.67 
 
 
308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  40.67 
 
 
308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  44.32 
 
 
292 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2910  acetylglutamate kinase  47.43 
 
 
301 aa  211  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3249  acetylglutamate kinase  41.57 
 
 
299 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219346  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0539  acetylglutamate kinase  42.64 
 
 
288 aa  211  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000417739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3438  acetylglutamate kinase  41.57 
 
 
299 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  43.18 
 
 
292 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0195  acetylglutamate kinase  41.57 
 
 
299 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05261  acetylglutamate kinase  41.09 
 
 
283 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.108747  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0301  acetylglutamate kinase  46.3 
 
 
286 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.84379  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  42.01 
 
 
295 aa  209  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0554  acetylglutamate kinase  44.23 
 
 
297 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879034  normal  0.0558608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>