More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0301 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0301  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 286 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.84379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  75.52 
 
 		 285 aa  431  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0324  acetylglutamate kinase  77.19 
 
 		 287 aa  424  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.491958 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2865  acetylglutamate kinase  67.73 
 
 		 292 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1068  acetylglutamate kinase  68.09 
 
 		 293 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2729  acetylglutamate kinase  68.09 
 
 		 293 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0880  acetylglutamate kinase  65.85 
 
 		 304 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00277635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3330  acetylglutamate kinase  53.96 
 
 		 305 aa  298  6e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1203  acetylglutamate kinase  53.96 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815716 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  54.27 
 
 		 301 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  53.92 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  53.92 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  53.92 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  53.54 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  53.54 
 
 		 301 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  53.56 
 
 		 301 aa  292  5e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  53.58 
 
 		 301 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  53.17 
 
 		 303 aa  290  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  53.92 
 
 		 300 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  52.96 
 
 		 295 aa  286  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  52.76 
 
 		 306 aa  286  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0868  acetylglutamate kinase  55.79 
 
 		 304 aa  285  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  53.24 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  53.24 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3341  acetylglutamate kinase  54.83 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  51.96 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  51.96 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1384  acetylglutamate kinase  55.09 
 
 		 304 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971931  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3095  acetylglutamate kinase  54.48 
 
 		 302 aa  281  6.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0013  acetylglutamate kinase  53.57 
 
 		 302 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0962097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  52.11 
 
 		 313 aa  281  7.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  49.66 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  49.01 
 
 		 303 aa  280  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  52.46 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0297  acetylglutamate kinase  51.01 
 
 		 304 aa  278  7e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0633  acetylglutamate kinase  52.45 
 
 		 298 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0680  acetylglutamate kinase  52.1 
 
 		 298 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1326  acetylglutamate kinase  51.75 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0072  acetylglutamate kinase  51.9 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00499393 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  51.84 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1025  acetylglutamate kinase  53.17 
 
 		 296 aa  276  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4558  acetylglutamate kinase  52.72 
 
 		 304 aa  275  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0966  acetylglutamate kinase  53.17 
 
 		 296 aa  276  4e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1358  acetylglutamate kinase  52.46 
 
 		 296 aa  275  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  51.2 
 
 		 292 aa  275  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0075  acetylglutamate kinase  50.7 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  50.17 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0814  acetylglutamate kinase  51.93 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  50.87 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3071  acetylglutamate kinase  52.63 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.954536  normal  0.567123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0954  acetylglutamate kinase  52.28 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.576098 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  48.61 
 
 		 301 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3700  acetylglutamate kinase  52.28 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  51.58 
 
 		 299 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  49.65 
 
 		 295 aa  271  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  49.14 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0086  acetylglutamate kinase  49.3 
 
 		 295 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  49.65 
 
 		 295 aa  269  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7329  acetylglutamate kinase  51.05 
 
 		 298 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  48.8 
 
 		 292 aa  268  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1697  acetylglutamate kinase  48.4 
 
 		 299 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0444  acetylglutamate kinase  48.97 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  49.64 
 
 		 287 aa  265  5.999999999999999e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  49.3 
 
 		 300 aa  265  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2621  acetylglutamate kinase  51.93 
 
 		 298 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2342  acetylglutamate kinase  51.93 
 
 		 298 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791434  normal  0.660777 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  50.52 
 
 		 295 aa  265  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  48.57 
 
 		 287 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0380  acetylglutamate kinase  50 
 
 		 312 aa  265  8.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  47.4 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1081  acetylglutamate kinase  46.01 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0152417  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  48.75 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  51.24 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2297  acetylglutamate kinase  51.58 
 
 		 298 aa  262  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.719983  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  49.65 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  48.43 
 
 		 302 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0594  acetylglutamate kinase  47.6 
 
 		 321 aa  262  4.999999999999999e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0675136  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  45.15 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1864  acetylglutamate kinase  47.7 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  49.3 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2911  acetylglutamate kinase  48.1 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  47.77 
 
 		 292 aa  259  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  48.41 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  49.83 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  47.75 
 
 		 296 aa  258  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  47.8 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1906  acetylglutamate kinase  47.7 
 
 		 291 aa  256  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0488998  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  47.89 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  47.37 
 
 		 293 aa  256  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1351  acetylglutamate kinase  46.24 
 
 		 283 aa  256  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  43.99 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  47.35 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0128  acetylglutamate kinase  45.52 
 
 		 281 aa  255  8e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1831  acetylglutamate kinase  49.28 
 
 		 284 aa  254  9e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242164  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2910  acetylglutamate kinase  49.13 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2288  acetylglutamate kinase  46.81 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.574269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  47.35 
 
 		 297 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0771  acetylglutamate kinase  46.53 
 
 		 298 aa  252  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1496  acetylglutamate kinase  48.35 
 
 		 301 aa  251  7e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>