More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4380 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4380  acetylglutamate kinase  100 
 
 		 301 aa  598  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0082  acetylglutamate kinase  93.02 
 
 		 301 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0218  acetylglutamate kinase  93.02 
 
 		 301 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6099  acetylglutamate kinase  92.69 
 
 		 301 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0780503  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70280  acetylglutamate kinase  92.36 
 
 		 301 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0182  acetylglutamate kinase  91.64 
 
 		 301 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0306646  hitchhiker  0.000000157401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5289  acetylglutamate kinase  90.64 
 
 		 301 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.92163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02900  acetylglutamate kinase  91.3 
 
 		 300 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5543  acetylglutamate kinase  90.67 
 
 		 301 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5339  acetylglutamate kinase  90.97 
 
 		 301 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.866501  hitchhiker  0.00605357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5198  acetylglutamate kinase  90.64 
 
 		 301 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.934726  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3675  acetylglutamate kinase  75.51 
 
 		 300 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0797606  normal  0.0933841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0621  acetylglutamate kinase  73.91 
 
 		 302 aa  443  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000196007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3560  acetylglutamate kinase  73.17 
 
 		 290 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1899  acetylglutamate kinase  70.47 
 
 		 304 aa  428  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2984  N-acetylglutamate kinase  74.22 
 
 		 306 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2995  acetylglutamate kinase  69.33 
 
 		 301 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0104  acetylglutamate kinase  69.62 
 
 		 295 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.806574  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0084  acetylglutamate kinase  68.81 
 
 		 304 aa  404  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2781  acetylglutamate kinase  66.22 
 
 		 300 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0179  acetylglutamate kinase  67.48 
 
 		 295 aa  391  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.137233  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2296  acetylglutamate kinase  69.34 
 
 		 300 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1828  acetylglutamate kinase  66.55 
 
 		 303 aa  381  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000670932  unclonable  0.000000000710864 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0579  acetylglutamate kinase  65.99 
 
 		 303 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.503767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1164  acetylglutamate kinase  65.64 
 
 		 300 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.113745  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0568  acetylglutamate kinase  65.66 
 
 		 299 aa  371  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2255  acetylglutamate kinase  63.3 
 
 		 294 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0153182  hitchhiker  0.00000292258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0064  acetylglutamate kinase  62.28 
 
 		 298 aa  362  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0433  acetylglutamate kinase  61.46 
 
 		 290 aa  360  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.394347  hitchhiker  0.0000000109203 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0256  acetylglutamate kinase  61.46 
 
 		 290 aa  360  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0629  acetylglutamate kinase  61.07 
 
 		 295 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.615358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1116  acetylglutamate kinase  64.44 
 
 		 293 aa  353  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0185  acetylglutamate kinase  61.56 
 
 		 292 aa  348  5e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0033  acetylglutamate kinase  59.73 
 
 		 310 aa  348  6e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2413  acetylglutamate kinase  59.86 
 
 		 296 aa  345  5e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3717  acetylglutamate kinase  59.38 
 
 		 308 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0140  acetylglutamate kinase  58.68 
 
 		 344 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3394  acetylglutamate kinase  59.03 
 
 		 308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0180  acetylglutamate kinase  58.33 
 
 		 309 aa  342  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0380  acetylglutamate kinase  58.59 
 
 		 351 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2179  acetylglutamate kinase  58.59 
 
 		 351 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2910  acetylglutamate kinase  58.59 
 
 		 351 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.290051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0185  acetylglutamate kinase  58.59 
 
 		 351 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.651482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0225  acetylglutamate kinase  61.27 
 
 		 292 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21956  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3249  acetylglutamate kinase  58.59 
 
 		 299 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0160  acetylglutamate kinase  59.72 
 
 		 355 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3438  acetylglutamate kinase  58.59 
 
 		 299 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0195  acetylglutamate kinase  58.59 
 
 		 299 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0150  acetylglutamate kinase  60.92 
 
 		 292 aa  338  8e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0064  acetylglutamate kinase  59.38 
 
 		 299 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4385  acetylglutamate kinase  57.91 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0338  acetylglutamate kinase  57.91 
 
 		 299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3092  acetylglutamate kinase  58.53 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144382 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3143  acetylglutamate kinase  58.59 
 
 		 344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3005  acetylglutamate kinase  58.59 
 
 		 299 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.68107 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3682  N-acetylglutamate kinase  58.3 
 
 		 294 aa  335  5e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2686  N-acetylglutamate kinase  58.33 
 
 		 293 aa  335  7.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6447  acetylglutamate kinase  58.59 
 
 		 299 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3112  acetylglutamate kinase  58.59 
 
 		 299 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.421465 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1730  acetylglutamate kinase  58.68 
 
 		 300 aa  335  7.999999999999999e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2482  acetylglutamate kinase  59.72 
 
 		 321 aa  334  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3096  acetylglutamate kinase  59.72 
 
 		 321 aa  334  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0983385  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3479  acetylglutamate kinase  59.58 
 
 		 306 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0564956  normal  0.537456 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2013  acetylglutamate kinase  57.99 
 
 		 300 aa  332  4e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3524  acetylglutamate kinase  58.8 
 
 		 296 aa  332  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3982  acetylglutamate kinase  59.72 
 
 		 305 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0203  acetylglutamate kinase  60.42 
 
 		 292 aa  331  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512987 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0499  acetylglutamate kinase  58.33 
 
 		 304 aa  330  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.600707 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0539  acetylglutamate kinase  58.36 
 
 		 303 aa  330  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0773  acetylglutamate kinase  57.99 
 
 		 297 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2015  acetylglutamate kinase  60.7 
 
 		 295 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000238351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3174  acetylglutamate kinase  58.1 
 
 		 292 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.696563  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0588  acetylglutamate kinase  56.94 
 
 		 296 aa  325  6e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.633832  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1226  acetylglutamate kinase  57.49 
 
 		 296 aa  325  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4139  acetylglutamate kinase  56.23 
 
 		 296 aa  325  6e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9539  hitchhiker  0.00000200653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0568  acetylglutamate kinase  56.94 
 
 		 301 aa  324  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1321  acetylglutamate kinase  57.29 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3740  acetylglutamate kinase  58.1 
 
 		 292 aa  322  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3635  acetylglutamate kinase  58.1 
 
 		 292 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3152  acetylglutamate kinase  57.69 
 
 		 292 aa  318  9e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1101  acetylglutamate kinase  56.45 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.419485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2494  acetylglutamate kinase  55.63 
 
 		 291 aa  316  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0415  acetylglutamate kinase  56.01 
 
 		 299 aa  315  5e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0188997  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2143  acetylglutamate kinase  55.56 
 
 		 336 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0550  acetylglutamate kinase  54.58 
 
 		 292 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3297  acetylglutamate kinase  53.45 
 
 		 303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3341  acetylglutamate kinase  56.34 
 
 		 310 aa  305  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0306  acetylglutamate kinase  58.68 
 
 		 320 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.531826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0633  acetylglutamate kinase  53.58 
 
 		 285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0273  acetylglutamate kinase  53.98 
 
 		 287 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0419762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0341  acetylglutamate kinase  54.17 
 
 		 305 aa  301  9e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1613  acetylglutamate kinase  56.94 
 
 		 308 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.778617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0568  acetylglutamate kinase  52.56 
 
 		 295 aa  299  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00120396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1864  acetylglutamate kinase  49.5 
 
 		 304 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0659  acetylglutamate kinase  51.57 
 
 		 299 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0464  acetylglutamate kinase  51.06 
 
 		 295 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0071  acetylglutamate kinase  50.35 
 
 		 295 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.428546  normal  0.0291112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0297  acetylglutamate kinase  51.71 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0352  acetylglutamate kinase  51.04 
 
 		 313 aa  295  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281091  normal  0.0894286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2289  acetylglutamate kinase  50.85 
 
 		 287 aa  295  5e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.99529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>